8-дневный растр MODIS в месячную сумму в R

У меня есть данные MODIS, которые содержат продукт за 8 дней. Некоторые месяцы имеют 3 изображения, а некоторые месяцы имеют четыре изображения. Итак, как я могу создать сценарий R для расчета ежемесячной суммы из этих данных?

Я использую набор данных MODIS MOD17A2HGF GPP, который представляет собой сетку 500x500 метров с суммой GPP за 8 дней. Первый файл заканчивается на _001, что означает, что он начинается 1 января и продолжается до 8 числа. Следующий файл, _009, охватывает период с 8 по 16 января и так далее. введите описание изображения здесь

Теперь я хочу суммировать GPP по месяцам (с января по декабрь).

В этой папке 920 файлов (20 лет), из которых каждый год 46 файлов.

В ArcGIS я знаю, как суммировать с помощью растрового калькулятора. Но если я буду суммировать каждый месяц, он будет делать столько повторяющейся работы.

введите описание изображения здесь

В R я пытался сделать это именно так

library(terra)
a <- rast('MOD17A2HGF_GPP_2001_001.tif')
b <- rast('MOD17A2HGF_GPP_2001_009.tif')
c <- rast('MOD17A2HGF_GPP_2001_017.tif')
d <- rast('MOD17A2HGF_GPP_2001_025.tif')
GPP_January <- a+b+c+d
writeRaster(GPP_January,'F:/test/GPP_January_2001.tif')

Он также будет выполнять так много повторяющихся работ, если я буду суммировать каждый месяц. Я не знаю, как выбрать указанные файлы месяца в цикле R.

Я знаю, как суммировать годовой GPP

library(tidyverse)
library(terra)

GPP2001 <- list.files(pattern = '2001',full.names = T) %>% 
  rast() %>% sum()

Но как я могу суммировать ежемесячные GPP в год в R или ArcGIS?

Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
0
0
23
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Получить все файлы/слои

library(terra)
ff <- list.files(pattern = "\\.tif$", full.names = T) 
r <- rast(ff) 

Для каждого файла извлеките год и номер дня.

# ff <- c('MOD17A2HGF_GPP_2001_001.tif', 'MOD17A2HGF_GPP_2001_009.tif')
s <- gsub('MOD17A2HGF_GPP_', "", basename(ff))
s <- gsub('.tif', "", s)
s <- strsplit(s, "_")
s <- do.call(rbind, s)
s
#     [,1]   [,2] 
#[1,] "2001" "001"
#[2,] "2001" "009"

Получить месяц и объединить с годом

d <- as.Date(as.numeric(s[,2]), origin = paste(s[,1], "-01-01", sep = "")) - 1
m <- format(d, "%m")
ym <- paste0(s[,1], m)
ym
#[1] "200101" "200101"

Теперь вы можете рассчитать среднемесячное значение следующим образом.

x <- tapp(x, ym, mean)

(точнее, среднее значение для дат каждого месяца; это не совсем среднемесячное значение, но, вероятно, достаточно хорошее).

Извините, это последний код 'x=tapp(r,ym,sum)'?

tigerwang 16.05.2022 22:34

Я не могу описать, насколько я взволнован в данный момент. Меня вдохновил аналогичный вопрос, на который вы ответили в 2018 году, и я подумал, что это идеально, но этот вопрос касался средних значений, и я не знаю, как изменить последнюю строку кода. Я не ожидал ответа оригинального автора вскоре после моего вопроса, который так волнует!

tigerwang 16.05.2022 22:38

Я использую mean (не sum), потому что вы заявили, что хотите вычислить «среднемесячное значение».

Robert Hijmans 16.05.2022 23:12

Я сожалею об этом, это ошибка. Я исправил это в своем описании. Большое спасибо за ответ и профессию!

tigerwang 16.05.2022 23:18

Сумма также немного подозрительна, потому что количество слоев в месяц будет варьироваться.

Robert Hijmans 16.05.2022 23:39

Другие вопросы по теме