Чередование цвета фона заголовка QTableView

Вы можете реализовать это поведение не с помощью qss, а с помощью подкласса QHeaderView. Например:

#include <QHeaderView>

class AlterHeader : public QHeaderView
{
    Q_OBJECT
public:
    explicit AlterHeader(Qt::Orientation orientation, QWidget *parent = nullptr);

protected:
    void paintSection(QPainter *painter, const QRect &rect, int logicalIndex) const;
};

void AlterHeader::paintSection(QPainter *painter, const QRect &rect, int logicalIndex) const
{
    Qt::Alignment align = (Qt::AlignHCenter | Qt::AlignVCenter);
    if (logicalIndex % 2 > 0) {
        painter->fillRect(rect, QColor("lightblue"));
    } else {
        painter->fillRect(rect, QColor("grey"));
    }
    painter->drawText(rect, align, QString::number(logicalIndex));
}

И используя:

AlterHeader *header = new AlterHeader(Qt::Vertical, ui->tableWidget);
ui->tableWidget->setVerticalHeader(header);

Несмотря на то, что эта тема была задана 6 месяцев назад, я наткнулся на нее только сейчас.

Ответ Сергея Кулиша очень помог, и я хотел бы предложить два улучшения (снова перезапись QHeaderClass, но альтернативно использование перезаписанного QStyle):

void AlternatingHeaderClass::paintSection(QPainter *painter, const QRect &rect, int logicalIndex) const {
    QAbstractItemView* abstractView(qobject_cast<QAbstractItemView*>(parent()));
    if (abstractView && abstractView->alternatingRowColors()) {
        QHeaderView::paintSection(painter, rect, logicalIndex);
        if (visualIndex(logicalIndex) % 2) {
            painter->fillRect(rect, QColor(0, 0, 0, 30));
        }
    } else {
        QHeaderView::paintSection(painter, rect, logicalIndex);
    }
}

Преимущество состоит в том, что он соблюдает настройки чередующихся строк своего родителя и использует visualIndex, чтобы он правильно отображался на экране. Минус в том, что текст тоже немного тускнеет. Кроме того, после этого выбор строки может завершиться ошибкой или ее необходимо добавить.

Более точно, эффекта можно было бы достичь, определив QStyle (как уже было предложено) со следующим методом в нем.

void AlternatingHeaderStyle::drawControl(
        ControlElement element,
        const QStyleOption *option,
        QPainter *painter,
        const QWidget *widget
) const {
    painter->save();
    switch (element) {
        case CE_HeaderSection:
            {
                const QStyleOptionHeader *headerOptionPtr(qstyleoption_cast<const QStyleOptionHeader *>(option));
                if (headerOptionPtr && (headerOptionPtr->orientation == Qt::Vertical)) {
                    QProxyStyle::drawControl(element, option, painter, widget);

                    QAbstractItemView* abstractView(qobject_cast<QAbstractItemView*>(widget->parent()));
                    if (abstractView && abstractView->alternatingRowColors()) {
                        const QHeaderView *verticalHeader(qobject_cast<const QHeaderView *>(widget));
                        if (verticalHeader && verticalHeader->visualIndex(headerOptionPtr->section) % 2) {
                            painter->fillRect(option->rect, QColor(0, 0, 0, 30));
                        }
                    }
                } else {
                    QProxyStyle::drawControl(element, option, painter, widget);
                }
            }

        default:
            QProxyStyle::drawControl(element, option, painter, widget);
            break;
    }
    painter->restore();        
}