Чтобы найти некоторые слова в текстовом файле с помощью регулярного выражения, а затем распечатать их в другом текстовом файле

В вашем коде были некоторые проблемы:

• Излишне определять re.compile внутри для.
• для re_pattern_object.findall('line') и origin_list.append('temp_list') не заключайте переменные в ''
• с findall нам не нужно повторять строки, это работает для всего текста.

Поскольку вы не предоставили ввод и вывод, я просто догадываюсь, что вы хотите:

import re

re_pattern_string = r'((?:inherit|INHERIT|Inherit)(\w*))'
originmain_list = []
re_pattern_object = re.compile(re_pattern_string)
print('Opening origin.txt')
with open('origin.txt', 'r') as in_stream:
    print('Opening origin_spp.txt')
    with open('origin_spp.txt', 'w') as out_stream:
        for num, line in enumerate(in_stream):
            temp_list = re_pattern_object.findall(line)
            for word in temp_list:
                out_stream.write(str(num) + '\t{0}\n'.format(word[0]))
                originmain_list.append((num, word[0]))

print("Done!")
print('origin.txt is closed?', in_stream.closed)
print('origin_spp.txt is closed?', out_stream.closed)
print(originmain_list)

если origin.txt содержит:

inheritxxxxxxx some text INHERITccccc some text
Inheritzzzzzzzz some text
inherit some text INHERIT some text
Inherit some text

вывод в origin_spp.txt будет

0   inheritxxxxxxx
0   INHERITccccc
1   Inheritzzzzzzzz
2   inherit
2   INHERIT
3   Inherit

Вывод командной строки будет:

Opening origin.txt
Opening origin_spp.txt
Done!
origin.txt is closed? True
origin_spp.txt is closed? True
[(0, 'inheritxxxxxxx'), (0, 'INHERITccccc'), (1, 'Inheritzzzzzzzz'), (2, 'inherit'), (2, 'INHERIT'), (3, 'Inherit')]