Cox PH со смешанными эффектами — время до события и как настроить выживание

Я прочитал все вопросы, похожие на "как рассчитать время до события/время между событиями" и документацию для Surv(), coxph, coxme. Мне все еще нужна помощь, чтобы подтвердить, правильно ли я настроил свои данные. Это представляет мои данные:

library(data.table)
library(survival)
library(coxme)
snippet <- data.table(age=c(rep(74,3),rep(73,3),rep(69,3)),
                      sex=c(rep(0,3),rep(1,3),rep(0,3)),
                      year=c(0:2,0:2,0:2),
                      CHEM_376=c(0.036469233, 0.262701338, 0.120690616, -0.197499658, -0.231236627, -0.368920289, -0.106358638, -0.055245055, -0.141187835),
                      subject=c(rep(1,3),rep(2,3),rep(3,3)),
                      status=c(0,0,1,0,0,1,0,0,1))

Я хочу запустить регрессию пропорциональных рисков Кокса с идентификатором субъекта в качестве случайного эффекта (из пакета coxme), химического вещества CHEM_376, измеряемого каждый год, и некоторых ковариантов, таких как возраст и мужчина. Следующее работает, но я не уверен, что это правильно:

coxph(Surv(time=year, event=status) ~ CHEM_376 + age + sex + cluster(subject), data=snippet)

Понимает ли пакет, что год — это номер года, когда произошли эти наблюдения, а не время изменения статуса? Нужно ли мне считать годы, пока статус не изменится на 1 для каждого человека? Я не уверен, как это сделать. Обратите внимание, что год не является форматом даты и времени posix. Спасибо за любую помощь заранее.

Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
0
0
50
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Когда вы создаете объект Survival с помощью Surv, аргумент time представляет собой интервал в годах (или днях, неделях и т. д.) между началом наблюдения и временем события. Вы также можете указать аргументы time и time2, чтобы указать время начала и окончания интервалов выживания.

Аргумент event указывает, произошло ли событие: 1 — да (субъект мертв), 0 — нет (субъект жив или подвергся цензуре — исключен из исследования и т. д.).

Google «Анализ выживания с R», чтобы найти несколько статей об этом.

Вы можете объяснить в контексте пакета coxme? он одновременно выполняет моделирование PH и смешанных эффектов.

Claire 11.04.2023 22:29

Другие вопросы по теме