Cuda group by и атомарные счетчики

У меня есть неупорядоченный массив помеченных элементов:

[0,1,0,2,0,1,2] // labels only

Что я хочу отсортировать:

[0,0,0,1,1,2,2]

Я уже посчитал, сколько элементов помечено каждой меткой и сведено в виде массива смещений:

[0,3,5]

это означает, что я знаю, что мне нужно хранить все элементы с меткой 0, начиная с позиции 0, элементы с меткой 1, начиная с позиции 3, и так далее.

template<typename T>
__global__ void GroupBy(T* output, T* input, int count, int* offsets) {
    int index = threadIdx.x + blockDim.x * blockIdx.x;
    T elem = input[index];
    output[offsets[elem.label]] = elem; // problem here
    atomicAdd(offsets[label], 1);
}

Однако операция чтения и записи перед atomicAdd не является атомарной, поэтому у меня есть состояние гонки памяти. У меня не было бы этого для одного счетчика, так как

int count = 0;
atomicAdd(&count, 1);
output[count] = elem;

действительно даст мне уникальный счетчик для каждого потока.

Как я могу решить эту проблему и иметь динамический массив атомарных счетчиков?

Ваше использование atomicAdd неверно в обоих случаях (второй тоже гонка). Он возвращает предыдущее значение, когда применяется атомарное обновление, поэтому поменяйте местами операции atomicAdd и присваивания (последнее использует возвращаемое значение atomicAdd), и ваша проблема исчезнет.

talonmies 30.07.2019 10:02

Черт спасибо. Не думал о возвращаемом значении atomicAdd. Мне стыдно

Regis Portalez 30.07.2019 10:08

НП. Хотите добавить краткий ответ самостоятельно? Вероятно, где-то есть дубликат для этого, но самостоятельный ответ уберет это из очереди без ответа.

talonmies 30.07.2019 10:12

Да, я только что сделал. Я действительно не нашел подходящего дубликата (поэтому я и задал вопрос в первую очередь).

Regis Portalez 30.07.2019 10:18
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
1
4
232
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Благодаря любезному напоминанию talonmies о возвращаемом значении atomicAdd, я смог исправить это в своем ядре:

template<typename T>
__global__ void GroupBy(T* output, T* input, int count, int* offsets) {
    int index = threadIdx.x + blockDim.x * blockIdx.x;
    T elem = input[index];
    int oldOffset = atomicAdd(&offsets[elem.label], 1);
    output[oldOffset] = elem; 
}

Действительно, atomicAdd атомарно увеличивает то, что хранится в первом аргументе, и возвращает старое значение:

[atomicAdd(address, val)] reads the 16-bit, 32-bit or 64-bit word old located at the address address in global or shared memory, computes (old + val), and stores the result back to memory at the same address. These three operations are performed in one atomic transaction. The function returns old.

https://docs.nvidia.com/cuda/cuda-c-programming-guide/index.html#atomicadd

у вас опечатка, atomicAdd нужен адрес в качестве первого аргумента

Oblivion 03.08.2019 17:57

Другие вопросы по теме