Фильтрация данных со списком идентификаторов в r

Проблема:Я хочу отфильтровать файл данных со списком значений

Вопрос ; как я могу это сделать? Какие библиотеки или функции позволят это сделать?

Деталь:У меня есть два файла: Файл1:

У меня есть общий файл данных набора генов (> 3000) с несколькими столбцами данных, включая имена генов.

Файл 2: У меня есть второй файл данных, который представляет собой список конкретных имен генов, которые меня интересуют. Это один столбец с 1900 строками.

Я хотел бы отфильтровать набор данных файла 1 по списку в фильме 2, чтобы оставить мне выходные данные этих выбранных генов и их данных.

Я видел использование функций 'strings' и 'dyplyr', но похоже, что это работает при установке порогового значения (> 2 и т. д.) Или использовании заданных фраз (например, 'null'). В этом случае я не хочу записывать 1900 значений «XXXX» и в идеале хотел бы вызывать файлы csv с именами генов, а затем применять фильтр «строка за строкой», то есть фильтровать общий файл по каждому строка? (если это лучший способ сделать это).

Спасибо заранее за любые предложения.

Добро пожаловать в StackOverflow! Пожалуйста, прочтите информацию о как задать хороший вопрос и о том, как дать воспроизводимый пример. Это облегчит другим помощь вам.

Cath 31.03.2021 12:03

Вам нужен оператор %in%. Например. file1 %>% filter(gene.id %in% file2.gene.id). (Использует dplyr / tidyverse.)

van Nijnatten 31.03.2021 12:36
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
2
2
25
0

Другие вопросы по теме