Ggplot2 возвращает пустой график после поворота x-labels

Я получил данные для сравнения двух геномов (столбец 1 и 2) и их сходство с индексом, указывающим количество сравнений геномов для вида:

 Genome1               Genome2             % of similarity 1 in 2   % of similarity 2 in 1       Species        index
 1: GCF_001956585.1 GCF_002860635.1                  65.2                  65.0      Actinomyces_naeslundii     1
 2: GCF_001937545.1 GCF_001937675.1                  78.8                  79.1            Actinomyces_oris     1
 3: GCF_001937545.1 GCF_001937725.1                  80.9                  73.5            Actinomyces_oris     2
 4: GCF_001937675.1 GCF_001937725.1                  78.4                  71.1            Actinomyces_oris     3
 5: GCF_001262035.1 GCF_003130125.1                  92.6                  93.5 Aggregatibacter_aphrophilus     1
 6: GCF_001262035.1 GCF_003252995.1                  82.8                  84.3 Aggregatibacter_aphrophilus     2
 7: GCF_003130125.1 GCF_003252995.1                  84.5                  84.8 Aggregatibacter_aphrophilus     3
 8: GCF_001059425.1 GCF_003130095.1                  92.4                  89.3      Aggregatibacter_segnis     1
 9: GCF_001059425.1 GCF_003252685.1                  90.1                  90.1      Aggregatibacter_segnis     2
10: GCF_003130095.1 GCF_003252685.1                  87.0                  89.8      Aggregatibacter_segnis     3

Я пытался повернуть x-метки графика geom_points. Ggplot2 возвращает пустой график после поворота x-labels

Метка успешно повернута, но график пуст (нет данных).

Ggplot2 возвращает пустой график после поворота x-labels

g <- ggplot(data = compareset, aes(x = Species, y =`% of similarity 1 in 2`, col = index))
g + geom_point()
g + theme(axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1))

Пожалуйста, предоставьте некоторые данные, которые облегчат ответ. См. здесь stackoverflow.com/questions/5963269/…

— 29.05.2019 11:43

Вы не сохранили результат g + geom_point() обратно в g.

— 29.05.2019 12:05

@AlmogAngel Мой пост отвечает на ваш вопрос?

— 29.05.2019 17:17

Да спасибо!

— 30.05.2019 09:33

r ggplot2

29.05.2019 11:37

Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?

Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...

Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией

В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.

Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox

Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...

Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest

В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...

Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️

Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...

Пользовательский скаляр GraphQL

Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...

322

Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Код работает для меня. Посмотреть здесь

Данные

set.seed(1)
myFun <- function(n) {
  a <- do.call(paste0, replicate(5, sample(LETTERS, n, TRUE), FALSE))
  paste0(a, sprintf("%04d", sample(9999, n, TRUE)), sample(LETTERS, n, TRUE))
}

n <- 20
compareset <- data.frame(Species= myFun(n=n), y= rnorm(n), index= factor(rep(c(1,2), n/2)))

Ваш код

library(ggplot2)

g <- ggplot(data = compareset, aes(x = Species, y = y, col = index))
g <- g + geom_point()
g <- g + theme(axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1))
g

Как указывает Z.Lin, вы не сохранили результат g + geom_point() обратно в g. Это то, что я сделал «автоматически», используя ваш код, и это сработало. Так что это то, что вы должны попробовать.

РЕДАКТИРОВАТЬ

Спасибо за данные. С переназначением новых изменений на g работает. Здесь:

compareset <- data.frame(similarity= c(65.2, 78.8, 80.9, 78.4, 92.6,
                                       82.8, 84.5, 92.4, 90.1, 87.0),
                         Species= c("Actinomyces_naeslundii1", "Actinomyces_oris1", "Actinomyces_oris2", "Actinomyces_oris3", "Aggregatibacter_aphrophilus1",
                                  "Aggregatibacter_aphrophilus2", "Aggregatibacter_aphrophilus3", "Aggregatibacter_segnis1", "Aggregatibacter_segnis2", "Aggregatibacter_segnis3"),
                         index= c(1,1,2,3,1,2,3,1,2,3))

g <- ggplot(data = compareset, aes(x = Species, y = similarity, col = index))
g <- g + geom_point()
g <- g + theme(axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1))
g

plot