Groupby Sum и Flatten Multi-Row Index DataFrame

Кажется, что вы можете просто сделать stack и value_counts:

index_cols = df.filter(like='Index ').columns
flattened_series = df[index_cols].stack().value_counts(sort=False)

Выход:

>>> flattened_series
A      3
a1     2
C      2
a11    1
a12    1
a2     1
a21    1
B      1
b1     1
b11    1
c1     1
c11    1
c2     1
c21    1
dtype: int64

Это просто подсчитывает значения столбцов индекса; на самом деле он не суммирует значения столбца Value. Выполнение тот также было бы довольно простым:

flattened_summed_series = df.set_index('Value').stack().reset_index(level=0).groupby(0, sort=False)['Value'].sum().rename_axis(None)

Выход:

>>> flattened_summed_series
A      3
a1     2
a11    1
a12    1
a2     1
a21    1
B      1
b1     1
b11    1
C      2
c1     1
c11    1
c2     1
c21    1
Name: Value, dtype: int64