Имена строк исчезают после as.matrix

Я точно не знаю, почему это происходит, но один из способов исправить это — включить аргумент rownames.force = T внутрь as.matrix

rownames(as.matrix(test, rownames.force = T))

Прежде всего, у нас всегда есть числовой индекс для поднастройки, который не исчезнет и его не следует путать со строкой имена.

as.matrix(test)[c(1, 3), ]
#        x   y
# [1,] 0.1 0.1
# [2,] 1.0 0.3

ЧТО происходит при использовании rownames, это функция dimnames в безмятежном исходном коде base:::rownames(),

function (x, do.NULL = TRUE, prefix = "row") 
{
  dn <- dimnames(x)
  if (!is.null(dn[[1L]])) 
    dn[[1L]]
  else {
    nr <- NROW(x)
    if (do.NULL) 
      NULL
    else if (nr > 0L) 
      paste0(prefix, seq_len(nr))
    else character()
  }
}

что дает NULL для dimnames(as.matrix(test))[[1]], но дает "1" "3" в случае dimnames(as.matrix(test[c(1, 3), ]))[[1]].

Обратите внимание, что метод base:::row.names.data.frame применяется в случае кадров данных, например. rownames(test).

ЧТО должно быть объяснено с ним, к счастью, вы не спросили ПОЧЕМУ, что было бы скорее основано на мнении.

Отличие кадра данных от матрицы:

?rownames

rownames(x, do.NULL = TRUE, prefix = "row")

Важная часть do.NULL = TRUE по умолчанию ИСТИНА: это означает:

Если do.NULL равно FALSE, вектор символов (длины NROW(x) или NCOL(x)) возвращается в любом случае,

Если замещающие версии вызываются для матрицы без каких-либо существующих имен dim, они добавят подходящие имена dim. Но такие конструкции, как

rownames(x)[3] <- "c"

может не работать, если x уже не имеет dimnames, так как это создаст значение длины 3 из значения NULL для rownames(x).

Для меня это означает (возможно, неправильное или профессиональное) применение функции rownames() к матрице, размеры строки должны быть объявлены до того, как вы получите NULL ->, потому что это настройка по умолчанию в функции rownames().

В вашем примере вы испытываете такое поведение: Здесь вы объявляете строки 1 и 3 и получаете 1 и 3

rownames(as.matrix(test[c(1, 3), ]))
[1] "1" "3"

Здесь вы ничего не объявляете и получаете NULL, потому что NULL используется по умолчанию.

rownames(as.matrix(test))
NULL

Вы можете преодолеть это, объявив перед:

rownames(test) <- 1:3

rownames(as.matrix(test))
[1] "1" "2" "3"

или вы могли бы сделать:

rownames(as.matrix(test), do.NULL = FALSE)
[1] "row1" "row2" "row3"
> rownames(as.matrix(test), do.NULL = FALSE, prefix = "")
[1] "1" "2" "3"

Аналогичный эффект с rownames.force: имена строк.force
логическое указание, должны ли результирующие матрицы иметь символьные (а не NULL) имена строк. По умолчанию, NA, используются имена строк NULL, если фрейм данных имеет «автоматические» имена строк или для фрейма данных с нулевой строкой. тусклые имена (matrix_test)

Вы можете включить rownames = TRUE при подаче заявки as.matrix

> as.matrix(test, rownames = TRUE)
    x   y
1 0.1 0.1
2 0.1 0.2
3 1.0 0.3

Существует разница между «автоматическими» и «неавтоматическими» именами строк.

Вот мотивирующий пример:

автоматический

test <- as.data.frame(list(x = c(0.1,0.1,1), y = c(0.1,0.2,0.3)))
rownames(test)
# [1] "1" "2" "3"

rownames(as.matrix(test))
# NULL

неавтоматический

test1 <- test
rownames(test1) <- as.character(1:3)
rownames(test1)
# [1] "1" "2" "3"

rownames(as.matrix(test1))
# [1] "1" "2" "3"

Вы можете прочитать об этом, например, в ?data.frame, в котором упоминается поведение, которое вы обнаружили в конце:

If row.names was supplied as NULL or no suitable component was found the row names are the integer sequence starting at one (and such row names are considered to be ‘automatic’, and not preserved by as.matrix).

Когда вы вызываете test[c(1, 3), ], вы неявно создаете не «автоматические» имена строк, что как бы задокументировано в ?Extract.data.frame:

If `[` returns a data frame it will have unique (and non-missing) row names.

(введите `[.data.frame` в свою консоль, если хотите углубиться в это.)

Другие уже показали, что это означает для вашего случая, см. аргумент rownames.force в ?matrix:

rownames.force: ... The default, NA, uses NULL rownames if the data frame has ‘automatic’ row.names or for a zero-row data frame.