ImportError и ModuleNotFoundError: как запустить скрипт из командной строки?

У меня есть проект со следующей структурой:

HorticulturalSalesPrediction/
    Docker
    HorticulturalSalesPrediction_API/
        optimization/
            __init__.py
            optuna_optim.py
        preprocess/
            __init__.py
            base_dataset.py
        utils/
            __init__.py
            FeatureAdder.py
            helper_functions.py
    __init__.py
    optim_pipeline.py
    run.py

В скрипте run.py я импортирую такие вещи:

import optim_pipeline
from utils import helper_functions

А в скрипте optim_pipeline.py я импортирую вот такие вещи:

from utils import helper_functions
from preprocess import base_dataset
from optimization import optuna_optim  

Я разработал эту структуру с помощью IDE PyCharm, и когда я запускаю ее с помощью кнопки «Выполнить», структура работает нормально. Но когда я хочу запустить его через терминал с помощью python3 run.py или python3 -m run.py, я получаю следующую ошибку:

Traceback (most recent call last):
  File "run.py", line 3, in <module>
    import optim_pipeline
  File "/home/josef/Schreibtisch/HorticulturalSalesPrediction/HorticulturalSalesPrediction/HorticulturalSalesPrediction_API/optim_pipeline.py", line 4, in <module>
    from preprocess import base_dataset
  File "/home/josef/Schreibtisch/HorticulturalSalesPrediction/HorticulturalSalesPrediction/HorticulturalSalesPrediction_API/preprocess/base_dataset.py", line 8, in <module>
    from HorticulturalSalesPrediction_API.utils import FeatureAdder
ModuleNotFoundError: No module named 'HorticulturalSalesPrediction_API'

Я знаю, что уже есть масса вопросов и решений по всей этой теме импорта python (Относительный импорт — ModuleNotFoundError: нет модуля с именем x, Вызвать функцию из другого файла?, Относительный импорт в миллиардный раз, ...), но ни один из них не сработал для меня.

Когда я печатаю sys.path, я среди прочих получаю '/home/josef/Schreibtisch/HorticulturalSalesPrediction/HorticulturalSalesPrediction/HorticulturalSalesPrediction_API', так что все это должно быть доступно на syspath.

Я также пытался сделать относительный и абсолютный импорт. Но при этих попытках я обнаруживаю ValueError: attempted relative import beyond top-level package или ImportError: attempted relative import with no known parent package ошибки (например, когда я пытаюсь from . import optim_pipeline).