Как активировать среду Anaconda в рецепте Singularity

Я пытаюсь создать образ и рецепт сингулярности, которые создадут среду anaconda, а затем активируют указанную среду, чтобы я мог построить колесо python проекта в этой среде, чтобы оно было на 100% установлено и функционировало после завершения сборки сингулярности.

Bootstrap: docker
From: nvidia/cuda:9.0-cudnn7-devel-ubuntu16.04

%environment

  # use bash as default shell
  SHELL=/bin/bash

  # add CUDA paths
  CPATH = "/usr/local/cuda/include:$CPATH"
  PATH = "/usr/local/cuda/bin:$PATH"
  LD_LIBRARY_PATH = "/usr/local/cuda/lib64:$LD_LIBRARY_PATH"
  CUDA_HOME = "/usr/local/cuda"

  # add Anaconda path
  PATH = "/usr/local/anaconda3/bin:$PATH"

  export PATH LD_LIBRARY_PATH CPATH CUDA_HOME
  export MKL_NUM_THREADS=1
  export OPENBLAS_NUM_THREADS=1

%setup
  # runs on host
  # the path to the image is $SINGULARITY_ROOTFS

%post
  # post-setup script

  # load environment variables
  . /environment

  # use bash as default shell
  echo "\n #Using bash as default shell \n" >> /environment
  echo 'SHELL=/bin/bash' >> /environment

  # make environment file executable
  chmod +x /environment

  # default mount paths
  mkdir /scratch /data 

  #Add CUDA paths
  echo "\n #Cuda paths \n" >> /environment
  echo 'export CPATH = "/usr/local/cuda/include:$CPATH"' >> /environment
  echo 'export PATH = "/usr/local/cuda/bin:$PATH"' >> /environment
  echo 'export LD_LIBRARY_PATH = "/usr/local/cuda/lib64:$LD_LIBRARY_PATH"' >> /environment
  echo 'export CUDA_HOME = "/usr/local/cuda"' >> /environment

  # updating and getting required packages
  apt-get update
  apt-get install -y wget git vim build-essential cmake

  # creates a build directory
  mkdir build
  cd build

  # download and install Anaconda
  CONDA_INSTALL_PATH = "/usr/local/anaconda3"
  wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.sh
  chmod +x Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.sh
  ./Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.sh -b -p $CONDA_INSTALL_PATH

  # download and install CaImAn
  git clone https://github.com/flatironinstitute/CaImAn.git
  cd CaImAn
  conda env create -n caiman -f environment.yml
  source activate caiman
  pip install .
  caimanmanager.py install
  source deactivate


%runscript
  # executes with the singularity run command
  # delete this section to use existing docker ENTRYPOINT command

%test
  # test that script is a success

Я пробовал как conda activate, так и source activate и получаю ту же ошибку для обоих.

+ source activate caiman
/bin/sh: 41: source: not found
ABORT: Aborting with RETVAL=255
Cleaning up...

Это просто то, что я должен сделать потом, сделав изображение доступным для записи? Это было бы следующим решением по умолчанию, но было бы неплохо, если бы рецепт мог просто работать.

*Редактировать 1 . activate caiman возвращается.

+ . activate caiman
+ [[ -n ]]
/bin/sh: 4: /usr/local/anaconda3/bin/activate: [[: not found
+ [[ -n ]]
/bin/sh: 7: /usr/local/anaconda3/bin/activate: [[: not found
+ echo Only bash and zsh are supported
Only bash and zsh are supported
+ return 1
ABORT: Aborting with RETVAL=255
Cleaning up...

* Редактировать 2 При использовании более новой версии Anaconda ошибка не найдена исчезает. Все, что я сделал, это изменил дистрибутив Anaconda, который я получил с помощью wget, а также принудительно обновил его, чтобы быть вдвойне уверенным.

# download and install Anaconda
  CONDA_INSTALL_PATH = "/usr/local/anaconda3"
  wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-5.3.1-Linux-x86_64.sh
  chmod +x Anaconda3-5.3.1-Linux-x86_64.sh
  ./Anaconda3-5.3.1-Linux-x86_64.sh -b -p $CONDA_INSTALL_PATH
  conda update -n base -c defaults conda
  pip install --upgrade pip