Как извлечь столбцы, которые содержат много значений 0, с помощью R?

У меня есть матрица с большим количеством столбцов (более 817 000) и 40 строк. Я хотел бы извлечь столбцы, которые содержат много 0 (например, > 30 или 35, независимо от числа).

Это должно выделить несколько столбцов, и я случайным образом выберу один, который буду использовать в качестве эталона для остальной части матрицы.

Есть идеи?

Редактировать :

              OTU0001 OTU0004 OTU0014 OTU0016 OTU0017 OTU0027 OTU0029 OTU0030
Sample_10.rare       0       0      85       0       0       0       0       0
Sample_11.rare       0      42     169       0      42     127       0      85
Sample_12.rare       0       0       0       0       0       0       0      42
Sample_13.rare     762     550    2159     127     550       0     677    1397
Sample_14.rare     847     508    2751     169    1397     169     593    1990
Sample_15.rare    1143     593    3725     677    2116     466     212    2286
Sample_16.rare    5630    5291    5291    1270    3852    1185     296    2836

Он должен извлечь 4 столбца, OTU0001 OTU0016 OTU0027 OTU0029 потому что они получили по 3 нуля в каждом. И если это возможно, я хотел бы извлечь позицию извлеченных столбцов.

Вы можете использовать colSums(df == 0), чтобы узнать, сколько 0 записей, и просто отфильтровать. Вы пробовали что-нибудь? Можем ли мы увидеть попытку?

Sotos 29.05.2019 15:46

Итак, для вашего примера что-то вроде mat[,colSums(mat == 0) >= 3]

Sotos 29.05.2019 15:50
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
2
2
283
2
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 2

Вы можете сделать что-то вроде этого (где 7 - количество соответствующих нулей):

library(dplyr)
df <- tibble(Col1 = c(rep(0, 10), rep(1, 10)),
                     Col2 = c(rep(0,5), rep(1, 15)),
                     Col3 = c(rep(0,15), rep(1, 5)))

y <- df %>% 
      select_if (function(col) length(which(col==0)) > 7)

К вашему сведению, ОП говорит, что у них есть матрица, а не фрейм данных / таблица.

Sotos 29.05.2019 15:57
Ответ принят как подходящий

Вариант с base R

Filter(function(x) sum(x == 0) > 7, df)

Другие вопросы по теме