Как мне интерпретировать цикл внутри массива numpy?

Вызов numpy.array() просто преобразует список Python в пустой массив. Вся логика происходит внутри понимания списка. Вы можете прочитать о понимании списков здесь: https://hackernoon.com/list-comprehension-in-python-8895a785550b

Понимание списка также может быть записано как цикл for, в этом случае есть два вложенных цикла:

eft = []

for n in conn:
  for i in range(dpn):
    eft.append(dpn * n + i)

По сути, это просто краткий способ создать новый список на основе некоторых других итераций.