Как объединить полное соединение и объединение обновления с переменным количеством столбцов, используя data.table

Я хотел бы объединить полное соединение и обновление соединения с переменным количеством столбцов и не нашел ответа, охватывающего этот случай, в stackoverflow.

DT моя исходная таблица:

   key_col value_col_1 value_col_2
    <char>       <int>       <int>
1:       a           1          11
2:       b           2          12
3:       c           3          13
4:       d           4          14
5:       e           5          15

который необходимо обновить данными в updateDT:

   key_col value_col_1 value_col_2 value_col_3
    <char>       <int>       <int>       <int>
1:       d          11          21          31
2:       e          12          22          32
3:       f          13          23          33
4:       g          14          24          34

updateDT может добавлять новые строки и столбцы (число варьируется) и всегда имеет приоритет над существующими данными в DT.

Ожидаемый результат (resultDT) для приведенного выше примера:

   key_col value_col_1 value_col_2 value_col_3
    <char>       <int>       <int>       <int>
1:       a           1          11          NA
2:       b           2          12          NA
3:       c           3          13          NA
4:       d          11          21          31
5:       e          12          22          32
6:       f          13          23          33
7:       g          14          24          34

Я могу добиться этого с помощью жестко закодированных имен столбцов, однако код повторяется, и я изо всех сил пытаюсь обобщить этот подход для обработки, например. третий или четвертый value_col в updateDT динамически:

library(data.table)

DT <- data.table(key_col = letters[1:5], value_col_1 = 1:5, value_col_2 = 11:15)
updateDT <- data.table(key_col = letters[4:7], value_col_1 = 11:14, value_col_2 = 21:24, value_col_3 = 31:34)
key_column <- "key_col"
value_columns <- setdiff(c(names(DT), names(updateDT)), key_column)

resultDT <- merge(DT, updateDT, by = "key_col", all = TRUE)
resultDT[, value_col_1 := fifelse(is.na(value_col_1.y), yes = value_col_1.x, no = value_col_1.y)]
resultDT[, value_col_2 := fifelse(is.na(value_col_2.y), yes = value_col_2.x, no = value_col_2.y)]
resultDT[, c("value_col_1.x", "value_col_1.y", "value_col_2.x", "value_col_2.y") := NULL]
print(resultDT)

Обновлено: принять ответ Исмиршерегала, поскольку он быстрее - Тест:

library(microbenchmark)
microbenchmark(
  ismirsehregal = {
    resultDT1 <- rbindlist(list(old = DT, new = updateDT), use.names = TRUE, fill = TRUE, idcol = "origin")[, key_count := .N, by = key_column]
    resultDT1 <- resultDT1[key_count == 1L | key_count > 1L & origin == 'new'][, c("key_count", "origin") := NULL]
    },
  Wimpel = {
    DT[updateDT, on=.(key_col), (value_columns) := mget(paste0("i.", value_columns))]
    resultDT2 <- rbindlist(list(DT, updateDT[!key_col %in% DT$key_col,]), use.names = TRUE, fill = TRUE)
    }, times = 10L)

Unit: milliseconds
          expr    min     lq    mean median     uq    max neval
 ismirsehregal 1.2166 1.2345 1.33790 1.2933 1.3531 1.8147    10
        Wimpel 3.5286 3.5989 3.85624 3.7680 4.0916 4.5984    10

2. Обновлено: пример updateDT, не содержащий всех столбцов DT:

library(data.table)

DT <- data.table(key_col = letters[1:5], value_col_1 = 1:5, value_col_2 = 11:15)
updateDT <- data.table(key_col = letters[4:7], value_col_2 = 11:14, value_col_3 = 21:24, value_col_4 = 31:34)
key_column <- "key_col"
# value_columns <- setdiff(c(names(DT), names(updateDT)), key_column) # Error: value for ‘i.value_col_1’ not found
value_columns <- setdiff(intersect(names(DT), names(updateDT)), key_column) # does not insert all data from updateDT

DT[updateDT, on=.(key_col), (value_columns) := mget(paste0("i.", value_columns))]
rbindlist(list(DT, updateDT[!key_col %in% DT$key_col,]), use.names = TRUE, fill = TRUE)

Я бы рассмотрел ответ @Wimpel, потому что: 1) он учитывает случай, когда не все столбцы DT находятся в updateDT (принятый ответ превратит значения DT в <NA> в обновленных строках для этих столбцов) и 2) Я думаю, что это может быть гораздо более эффективно с точки зрения использования памяти для реальных данных, потому что оно обновляет DT на месте, а затем складывает его только с отдельными строками updateDT, чтобы создать новый объект. Другой ответ создает очень большой новый объект (составляющий обе таблицы), а затем еще один, состоящий только из выбранных строк.

Tobo 26.06.2024 21:01

Кроме того, если вы действительно имеете в виду, что updateDT всегда содержит все столбцы DT (как в примере и принятом решении), возможно, это однострочный вариант: rbind(DT[!updateDT, on=.(key_col)], updateDT, use.names=TRUE, fill=TRUE).

Tobo 26.06.2024 21:14

Ответ @Tobo Wimpel не вставляет все данные updateDT, когда, например. value_col_1 не существует в updateDT. Пожалуйста, посмотрите мое редактирование. Тот же результат при установке origin == 'old' в моем коде.

ismirsehregal 27.06.2024 10:26

@ismirsehregal Ваша добавленная версия — это то, что у меня было для общего случая, и вы правы насчет ответа Wimpel. Исправление/адаптация: key_column <- "key_col", update_cols <- setdiff(names(updateDT), key_column), rbind(DT[updateDT, on=key_column, (update_cols) := mget(paste0("i.", update_cols))], updateDT[!DT, on=key_column], fill=TRUE). Это работает для различных столбцов в обеих таблицах (и делает имя ключевого столбца переменной), хотя, конечно, это все равно изменяет DT как побочный эффект. Итак, на самом деле три ответа. Было бы интересно понять, как они работают и почему.

Tobo 27.06.2024 19:59
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
3
4
87
2
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 2

Ответ принят как подходящий

Вы можете использовать rbindlist, чтобы добиться этого:

library(data.table)

DT <- data.table(key_col = letters[1:5], value_col_1 = 1:5, value_col_2 = 11:15)
updateDT <- data.table(key_col = letters[4:7], value_col_1 = 11:14, value_col_2 = 21:24, value_col_3 = 31:34)
key_column <- "key_col"
value_columns <- setdiff(c(names(DT), names(updateDT)), key_column)

resultDT <- rbindlist(list(old = DT, new = updateDT), use.names = TRUE, fill = TRUE, idcol = "origin")[, key_count := .N, by = key_column]
resultDT <- resultDT[key_count == 1L | key_count > 1L & origin == 'new'][, c("key_count", "origin") := NULL]
print(resultDT)

По сути, это привязка строк новой таблицы к старой и удаление дубликатов в зависимости от источника.

Обновлено: чтобы избежать удаления данных, если в updateDT существуют не все столбцы DT, мы можем просто добавить их заранее:

library(data.table)

DT <- data.table(key_col = letters[1:5], value_col_1 = 1:5, value_col_2 = 11:15)
updateDT <- data.table(key_col = letters[4:7], value_col_2 = 11:14, value_col_3 = 21:24, value_col_4 = 31:34)
key_column <- "key_col"
value_columns <- setdiff(c(names(DT), names(updateDT)), key_column)

keep_columns <- c(key_column, setdiff(names(DT), names(updateDT)))
updateDT <- DT[, ..keep_columns][updateDT, on = key_column]

resultDT <- rbindlist(list(old = DT, new = updateDT), use.names = TRUE, fill = TRUE, idcol = "origin")[, key_count := .N, by = key_column]
resultDT <- resultDT[key_count == 1L | key_count > 1L & origin == 'new'][, c("key_count", "origin") := NULL]
print(resultDT)

Таким же образом мы можем использовать однострочник @Tobo:

library(data.table)

DT <- data.table(key_col = letters[1:5], value_col_1 = 1:5, value_col_2 = 11:15)
updateDT <- data.table(key_col = letters[4:7], value_col_2 = 11:14, value_col_3 = 21:24, value_col_4 = 31:34)
key_column <- "key_col"

keep_columns <- c(key_column, setdiff(names(DT), names(updateDT)))
updateDT <- DT[, ..keep_columns][updateDT, on = key_column]
rbind(DT[!updateDT, on = key_column], updateDT, use.names = TRUE, fill = TRUE)

Немного другой подход, при котором вы сначала обновляете значения для уже существующих значений key_col, а затем привязываете строки к новым значениям key_col.

# first update join new values for matching key_col-values
DT[updateDT, on=.(key_col), (value_columns) := mget(paste0("i.", value_columns))]
# then rowbind missing key_col-values
rbindlist(list(DT, updateDT[!key_col %in% DT$key_col,]), use.names = TRUE, fill = TRUE)

выходы в

   key_col value_col_1 value_col_2 value_col_3
    <char>       <int>       <int>       <int>
1:       a           1          11          NA
2:       b           2          12          NA
3:       c           3          13          NA
4:       d          11          21          31
5:       e          12          22          32
6:       f          13          23          33
7:       g          14          24          34

как бы вы изменили свой код, чтобы использовать переменную key_column <- "key_col" вместо жесткого кодирования key_col?

ahnungslos 27.06.2024 09:51

Другие вопросы по теме