Как объединить строки из двух файлов?

используйте paste с настраиваемым разделителем \n, т.е. перевод строки:

paste -d '\n' file1 file2 > file.out

или GNU-сед:

sed 'R file2' file1

или авк:

awk 'NR==FNR{a[NR]=$0;next} {print a[FNR]} 1' file1 file2

paste — лучший способ, но с awk вы можете использовать getline для чтения из другого файла во время чтения некоторого файла:

awk -v f2 = "file2" '{print; getline < f2; print;}' file1

Не могли бы вы попробовать следующее решение, оно будет работать для более чем 2 входных_файлов, если у вас тоже есть.

awk 'FNR==NR{a[FNR]=$0;next} {a[FNR]=(a[FNR]?a[FNR] ORS:"")$0} END{for(i=1;i<=FNR;i++){print a[i]}}'  Input_file1  Input_file2

Обновлено: Добавление еще одного общего решения, где мы могли бы передать ему N файлов, более того, НЕ предполагается, что количество строк во всех Input_file (ах) одинаково, оно получает максимальное количество строк из всех файлов и выводит соответствие строки (с номером строки во всех файлах) и будут печатать строки (которых, наконец, больше в любом файле), если файлы OP имеют это условие.

Допустим, у нас есть 3 файла с именами file1, file2 и file3 следующим образом.

cat Input_file1
1
5
4

cat Input_file2
44
65
56

cat Input_file3
1
2
3
4
5
6

Теперь следующий код.

awk '
prev!=FILENAME{
   count=count>prev_count?count:prev_count
}
{
   prev_count=FNR
}
FNR==1{
   prev=FILENAME
}
FNR==NR{
   a[FNR]=$0
   next
}
{
   a[FNR]=(a[FNR]?a[FNR] ORS:"")$0
}
END{
   count=count>prev_count?count:prev_count
   for(i=1;i<=count;i++){
      print a[i]
   }
}'   Input_file1  Input_file2   Input_file3

Вывод будет следующим.

1
44
1
5
65
2
4
56
3
4
5
6