Мой входной файл выглядит следующим образом:

mpg,cylinder,displace,horsepower,weight,accelerate,year,origin,name
18,8,307,130,3504,12,70,1,chevy malibu
18,8,308,140,?.,14,70,1,plymoth satellite
18,8,309,150,?,15,70,1,ford torino
18,8,310,150,? ,16,70,1,ford galaxy
18,8,310,150, ?,17,70,1,pontiac catalina
18,8,310,150,3505,18,70,1,ford maverick

Код для замены любого из следующих вхождений ['?','?.',' ?','? '] выглядит следующим образом:

import csv
qs = ['?','?.',' ?','? ']
with open('abc.txt') as csv_file:
    csv_reader = csv.reader(csv_file, delimiter=',')
    for row in csv_reader:
        row = ['' if r in qs else r for r in row]
        print (row)

Результат этого будет следующим:

['mpg', 'cylinder', 'displace', 'horsepower', 'weight', 'accelerate', 'year', 'origin', 'name']
['18', '8', '307', '130', '3504', '12', '70', '1', 'chevy malibu']
['18', '8', '308', '140', '', '14', '70', '1', 'plymoth satellite']
['18', '8', '309', '150', '', '15', '70', '1', 'ford torino']
['18', '8', '310', '150', '', '16', '70', '1', 'ford galaxy']
['18', '8', '310', '150', '', '17', '70', '1', 'pontiac catalina']
['18', '8', '310', '150', '3505', '18', '70', '1', 'ford maverick']

Как видите, значения в строках с 3 по 6 заменены на ''.

Запустил еще один образец набора данных:

mpg,cylinder,displace,horsepower,weight,accelerate,year,origin,name
18,8,307,130,3504,12,70,1,chevy malibu
18,8,308,140,?.,14,70,1,plymoth satellite
18,8,309,?,3506,15,70,1,ford torino
18,8,310,160,? ,16,70,1,ford galaxy
18,8,311,170,3508, ?,70,1,pontiac catalina
18,8,312,180,3509,18,70,1,ford maverick

Выход:

['mpg', 'cylinder', 'displace', 'horsepower', 'weight', 'accelerate', 'year', 'origin', 'name']
['18', '8', '307', '130', '3504', '12', '70', '1', 'chevy malibu']
['18', '8', '308', '140', '', '14', '70', '1', 'plymoth satellite']
['18', '8', '309', '', '3506', '15', '70', '1', 'ford torino']
['18', '8', '310', '160', '', '16', '70', '1', 'ford galaxy']
['18', '8', '311', '170', '3508', '', '70', '1', 'pontiac catalina']
['18', '8', '312', '180', '3509', '18', '70', '1', 'ford maverick']

В этом случае ? находится в разных столбцах. Он по-прежнему решает проблему.

Если вы ищете все строки за один раз, вы можете прочитать все строки в одну переменную и обработать ее.

qs = {'?.':'',' ?':'','? ':'','?':''}
with open('abc.txt') as csv_file:
    lines = csv_file.readlines()
    for i,text in enumerate(lines):
        [text := text.replace(a,b) for a,b in qs.items()]
        lines[i] = text
    print (lines)

Ваши выходные данные будут следующими:

['mpg,cylinder,displace,horsepower,weight,accelerate,year,origin,name\n', '18,8,307,130,3504,12,70,1,chevy malibu\n', '18,8,308,140,,14,70,1,plymoth satellite\n', '18,8,309,,3506,15,70,1,ford torino\n', '18,8,310,160,,16,70,1,ford galaxy\n', '18,8,311,170,3508,,70,1,pontiac catalina\n', '18,8,312,180,3509,18,70,1,ford maverick\n']

вывод кортежа

Похоже, вы ожидаете кортежи в качестве вывода.

Вот код, чтобы сделать это:

import csv
qs = {'?.':'',' ?':'','? ':'','?':''}
final_list = []

with open('abc.txt') as csv_file:
    csv_reader = csv.reader(csv_file, delimiter=',')
    for row in csv_reader:
        row = ['' if r in qs else r for r in row]
        final_list.append(tuple(row))

print (final_list)

Вывод будет следующим:

[('mpg', 'cylinder', 'displace', 'horsepower', 'weight', 'accelerate', 'year', 'origin', 'name'), ('18', '8', '307', '130', '3504', '12', '70', '1', 'chevy malibu'), ('18', '8', '308', '140', '', '14', '70', '1', 'plymoth satellite'), ('18', '8', '309', '', '3506', '15', '70', '1', 'ford torino'), ('18', '8', '310', '160', '', '16', '70', '1', 'ford galaxy'), ('18', '8', '311', '170', '3508', '', '70', '1', 'pontiac catalina'), ('18', '8', '312', '180', '3509', '18', '70', '1', 'ford maverick')]