Как отладить график приложения Shiny, который не отображается

Я пытаюсь создать блестящее приложение для класса, которое позволит вам настроить простой график тепловой карты. Мне удалось получить желаемый вывод графика в R за пределами Shiny, но у меня возникли проблемы с реализацией приложения. Данные, которые я использую,

структура(список(Расстояние = c(100L, 100L, 100L, 100L, 100L, 100L, 100L, 100л, 100л, 150л, 150л, 150л, 150л, 150л, 150л, 150л, 150л, 150л, 200л, 200л, 200л, 200л, 200л, 200л, 200л, 200л, 200л, 250л, 250л, 250л, 250л, 250л, 250л, 250л, 250л, 250л, 300л, 300л, 300л, 300л, 300л, 300л, 300л, 300л, 300л, 350л, 350л, 350л, 350л, 350л, 350л, 350л, 350л, 350л, 400л, 400л, 400л, 400л, 400л, 400л, 400л, 400л, 400л, 450л, 450л, 450л, 450л, 450л, 450л, 450л, 450л, 450л), Направление = c("Центр", "Центр", "Центр", "Влево", "Влево", "Влево", «Право», «Право», «Право», «Центр», «Центр», «Центр», «Налево», «Левый», «Левый», «Правый», «Правый», «Правый», «Центр», «Центр», «Центр», «Левый», «Левый», «Левый», «Правый», «Правый», «Правый», «Центр», «Центр», «Центр», «Налево», «Налево», «Налево», «Направо», «Право», «Право», «Центр», «Центр», «Центр», «Налево», «Налево», «Левый», «Правый», «Правый», «Правый», «Центр», «Центр», «Центр», «Левый», «Левый», «Левый», «Правый», «Правый», «Правый», «Центр», «Центр», «Центр», «Левый», «Левый», «Левый», «Правый», «Правый», «Право», «Центр», «Центр», «Центр», «Налево», «Налево», «Налево», "Вправо", "Вправо", "Вправо"), Смещение = c(0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 7,5, 7,5, 7,5, 7,5, 7,5, 7.5), Высота = c(12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л , 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л, 12л, 24л, 36л), по горизонтали = c(0,1, 0,15, 0,1, 0,04, 0,03, 0,02, 0,13, 0,11, 0,06, 0,05, 0,06, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,04, 0,06, 0,04, 0,02, 0,02, 0,02, 0,01, 0,01, 0,02, 0,03, 0,02, 0,02, 0,04, 0,02, 0,02, 0,01, 0,01, 0,01, 0,05, 0,04, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,01, 0,01, 0,01, 0,03, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,01, 0,01, 0,01, 0,01, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,01, 0,01, 0,01, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02, 0,01, 0,02, 0,02, 0,02, 0,02), Вертикально = c(2,3, 1,43, 0,7, 0,49, 0,12, 0,07, 0,88, 0,74, 0,6, 0,47, 0,34, 0,23, 0,04, 0,04, 0,03, 0,5, 0,43, 0,32, 0,3, 0,23, 0,17, 0,03, 0,02, 0,02, 0,3, 0,25, 0,19, 0,3, 0,23, 0,17, 0,03, 0,03, 0,03, 0,3, 0,25, 0,2, 0,17, 0,13, 0,1, 0,02, 0,02, 0,02, 0,2, 0,18, 0,15, 0,14, 0,12, 0,09, 0,02, 0,02, 0,02, 0,2, 0,15, 0,15, 0,1, 0,08, 0,07, 0,02, 0,02, 0,01, 0,11, 0,09, 0,09, 0,09, 0,08, 0,06, 0,05, 0,05, 0,04, 0,12, 0.1, 0.07)) class = "data.frame", row.names = c(NA, -72L))

И полный код моего приложения:

library(shiny)
library(shinyjs)
library(ggplot2)
library(dplyr)
library(DT)
jsCode <- "
shinyjs.colorInputBinding = function() {
  $('#colorLowInput').on('change', function() {
    Shiny.setInputValue('colorLow', $('#colorLowInput').val());
  });
  $('#colorHighInput').on('change', function() {
    Shiny.setInputValue('colorHigh', $('#colorHighInput').val());
  });
}"

#read in the data
light_data <- read.csv("lightData.csv",
                       header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE)


ui <- fluidPage(
  useShinyjs(),
  titlePanel("Dynamic Heatmap and Data Display"),
  extendShinyjs(text = jsCode, functions = c("colorInputBinding")),
  
  
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      tags$label("Lower Color"),
      tags$input(type = "color", id = "colorLowInput", value = "#0000FF"),
      tags$br(),
      tags$label("Higher Color"),
      tags$input(type = "color", id = "colorHighInput", value = "#FF0000"),
      sliderInput("heightFilter", "Select Height", min = 12, max = 36, value = c(12, 36)),
      radioButtons("dataView", "Select Data View", choices = list("All Data" = "all", "Filtered Data" = "filtered"))
    ),
      mainPanel(
        tabsetPanel(id = "MainPanel", selected = "Plot Output",
                    tabPanel(Title = "Plot Output", value = "Plot",  plotOutput(outputId = "heatmap")),
                    tabPanel(Title = "Data Table", value = "Table", DTOutput(outputId = "dataTable"))
        )
      )
  ),
)

server <- function(input, output, session) {
  
  filtered_data <- reactive({
    data <- light_data %>%
      filter(Height >= input$heightFilter[1] & Height <= input$heightFilter[2])
    if (input$dataView == "filtered") {
      return(data)
    } else {
      return(light_data)
    }
  })
  
  output$heatmap <- renderPlot({
    req(input$colorLow, input$colorHigh)
    data <- filtered_data()
    #print(head(data))
    #if (nrow(data) == 0) {
    #  return()
    #}
    
    ggplot(data, aes(x = Distance, y = factor(Height), fill = Horizontal)) +
      geom_tile() +
      scale_fill_gradient(low = input$colorLow, high = input$colorHigh) +
      labs(title = "Heatmap of Horizontal Light Intensity",
           x = "Distance from Truck (ft)",
           y = "Height (in)",
           fill = "Intensity (Fc)") +
      theme_minimal()
  }, height = "auto",
  width = "auto")
  
  output$dataTable <- renderDT({
    datatable(filtered_data(), options = list(pageLength = 5))
  })
}

shinyApp(ui, server)

Когда я запускаю приложение, я не вижу ожидаемых вкладок, и появляется сообщение об ошибке с надписью error: figure margins too large. Я думал, что наличие height = "auto", width = "auto" в renderPlot() позаботится об этом?

Вполне возможно, что я что-то напортачил с реактивной фильтрацией данных, но я не знаю, как это отладить с этой точки.

Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
0
0
57
2
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 2

Ответ принят как подходящий

Один из лучших подходов к отладке — начать с нуля и тестировать фрагменты по мере их добавления.

Например, я начал с вашего реактива filtered_data и убедился, что он выводит данные нужным образом. Я сделал одну вещь: cat(length(filtered_data()[[1]])) в качестве первой строки в вашем renderPlot(), чтобы проверить, удаляет ли фильтрация строки. Затем я обратил внимание на ваш сюжет, где закомментировал все строки и добавлял их одну за другой, пока не обнаружил проблему со строкой scale_fill_gradient(). Это привело меня к выводу, что с реализацией палитры цветов возникли проблемы. Вместо того, чтобы отлаживать это, я предлагаю использовать предварительно настроенную палитру цветов из пакета {colourpicker}.

Вот ваш код с этими изменениями:

  1. Переключился на использование colourpicker::colourInput(), чтобы избежать сложностей с вводом собственного цвета.
  2. Отредактировано с Title на title в обоих tabPanel()s.
  3. Для аргумента selected для tabsetPanel() используйте аргумент tabPanel()value вместо аргумента title.
library(shiny)
library(ggplot2)
library(dplyr)
library(DT)
library(colourpicker)

light_data <- structure(list(Distance = c(100L, 100L, 100L, 100L, 100L, 100L, 100L, 100L, 100L, 150L, 150L, 150L, 150L, 150L, 150L, 150L, 150L, 150L, 200L, 200L, 200L, 200L, 200L, 200L, 200L, 200L, 200L, 250L, 250L, 250L, 250L, 250L, 250L, 250L, 250L, 250L, 300L, 300L, 300L, 300L, 300L, 300L, 300L, 300L, 300L, 350L, 350L, 350L, 350L, 350L, 350L, 350L, 350L, 350L, 400L, 400L, 400L, 400L, 400L, 400L, 400L, 400L, 400L, 450L, 450L, 450L, 450L, 450L, 450L, 450L, 450L, 450L ), Direction = c("Center", "Center", "Center", "Left", "Left", "Left", "Right", "Right", "Right", "Center", "Center", "Center", "Left", "Left", "Left", "Right", "Right", "Right", "Center", "Center", "Center", "Left", "Left", "Left", "Right", "Right", "Right", "Center", "Center", "Center", "Left", "Left", "Left", "Right", "Right", "Right", "Center", "Center", "Center", "Left", "Left", "Left", "Right", "Right", "Right", "Center", "Center", "Center", "Left", "Left", "Left", "Right", "Right", "Right", "Center", "Center", "Center", "Left", "Left", "Left", "Right", "Right", "Right", "Center", "Center", "Center", "Left", "Left", "Left", "Right", "Right", "Right"), Offset = c(0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 20, 20, 20, 20, 20, 20, 0, 0, 0, 7.5, 7.5, 7.5, 7.5, 7.5, 7.5), Height = c(12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L, 12L, 24L, 36L), Horizontal = c(0.1, 0.15, 0.1, 0.04, 0.03, 0.02, 0.13, 0.11, 0.06, 0.05, 0.06, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.04, 0.06, 0.04, 0.02, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.02, 0.03, 0.02, 0.02, 0.04, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.05, 0.04, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.03, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.01, 0.01, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02, 0.01, 0.02, 0.02, 0.02, 0.02), Vertical = c(2.3, 1.43, 0.7, 0.49, 0.12, 0.07, 0.88, 0.74, 0.6, 0.47, 0.34, 0.23, 0.04, 0.04, 0.03, 0.5, 0.43, 0.32, 0.3, 0.23, 0.17, 0.03, 0.02, 0.02, 0.3, 0.25, 0.19, 0.3, 0.23, 0.17, 0.03, 0.03, 0.03, 0.3, 0.25, 0.2, 0.17, 0.13, 0.1, 0.02, 0.02, 0.02, 0.2, 0.18, 0.15, 0.14, 0.12, 0.09, 0.02, 0.02, 0.02, 0.2, 0.15, 0.15, 0.1, 0.08, 0.07, 0.02, 0.02, 0.01, 0.11, 0.09, 0.09, 0.09, 0.08, 0.06, 0.05, 0.05, 0.04, 0.12, 0.1, 0.07)), class = "data.frame", row.names = c(NA, -72L))

ui <- fluidPage(
  titlePanel("Dynamic Heatmap and Data Display"),
  
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      colourInput("colorLowInput", "Lower Color", value = "#0000FF"),
      tags$br(),
      colourInput("colorHighInput", "Higher Color", value = "#FF0000"),
      sliderInput(
        "heightFilter",
        "Select Height",
        min = 12,
        max = 36,
        value = c(12, 36)
      ),
      radioButtons(
        "dataView",
        "Select Data View",
        choices = list("All Data" = "all", "Filtered Data" = "filtered")
      )
    ),
    mainPanel(
      tabsetPanel(
        id = "MainPanel",
        selected = "Plot",
        tabPanel(
          title = "Plot Output",
          value = "Plot",
          plotOutput(outputId = "heatmap")
        ),
        tabPanel(
          title = "Data Table",
          value = "Table",
          DTOutput(outputId = "dataTable")
        )
      )
    )
  ),
)

server <- function(input, output, session) {
  filtered_data <- reactive({
    data <- light_data %>%
      filter(Height >= input$heightFilter[1] &
               Height <= input$heightFilter[2])
    if (input$dataView == "filtered") {
      return(data)
    } else {
      return(light_data)
    }
  })
  
  output$heatmap <- renderPlot({
    ggplot(filtered_data(), aes(
      x = Distance,
      y = factor(Height),
      fill = Horizontal
    )) +
      geom_tile() +
      scale_fill_gradient(low = input$colorLowInput,
                          high = input$colorHighInput) +
      labs(
        title = "Heatmap of Horizontal Light Intensity",
        x = "Distance from Truck (ft)",
        y = "Height (in)",
        fill = "Intensity (Fc)"
      ) +
      theme_minimal()
  })
  
  output$dataTable <- renderDT({
    datatable(filtered_data(), options = list(pageLength = 5))
  })
}

shinyApp(ui, server)
#> 
#> Listening on http://127.0.0.1:7769

Created on 2024-04-22 with reprex v2.1.0

Проблема с высотой в том, что если вы укажете width = "auto" и height = "auto" в renderPlot, это даст (из ?renderPlot)

«auto», по умолчанию, использует размер, указанный в методеplotOutput() (т. е. offsetWidth/'offsetHeight' HTML-элемента, привязанного к этому графику.)

А эти (width = "100%", height = "400px", from ?plotOutput) не подходят для реализации внутри вашего tabsetPanel, поэтому вам следует явно задать подходящие значения внутри renderPlot.

Кроме того, обратите внимание, что вам нужно вызвать js$colorInputBinding() внутри server, поскольку в противном случае ваш js не будет вызван.

library(shiny)
library(shinyjs)
library(ggplot2)
library(dplyr)
library(DT)

jsCode <- "
shinyjs.colorInputBinding = function() {
  $('#colorLowInput').on('change', function() {
    Shiny.setInputValue('colorLow', $('#colorLowInput').val());
  });
  $('#colorHighInput').on('change', function() {
    Shiny.setInputValue('colorHigh', $('#colorHighInput').val());
  });
}"

#read in the data
light_data <- read.csv("lightData.csv",
                       header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE)


ui <- fluidPage(
  useShinyjs(),
  titlePanel("Dynamic Heatmap and Data Display"),
  extendShinyjs(text = jsCode, functions = c("colorInputBinding")),
  
  
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      tags$label("Lower Color"),
      tags$input(
        type = "color",
        id = "colorLowInput",
        value = "#0000FF"
      ),
      tags$br(),
      tags$label("Higher Color"),
      tags$input(
        type = "color",
        id = "colorHighInput",
        value = "#FF0000"
      ),
      sliderInput(
        "heightFilter",
        "Select Height",
        min = 12,
        max = 36,
        value = c(12, 36)
      ),
      radioButtons(
        "dataView",
        "Select Data View",
        choices = list("All Data" = "all", "Filtered Data" = "filtered")
      )
    ),
    mainPanel(
      tabsetPanel(
        id = "MainPanel",
        selected = "Plot Output",
        tabPanel(
          Title = "Plot Output",
          value = "Plot",
          plotOutput(outputId = "heatmap")
        ),
        tabPanel(
          Title = "Data Table",
          value = "Table",
          DTOutput(outputId = "dataTable")
        )
      )
    )
  ),
)

server <- function(input, output, session) {
  filtered_data <- reactive({
    data <- light_data %>%
      filter(Height >= input$heightFilter[1] &
               Height <= input$heightFilter[2])
    if (input$dataView == "filtered") {
      return(data)
    } else {
      return(light_data)
    }
  })
  
  output$heatmap <- renderPlot({
    data <- filtered_data()
    
    ggplot(data, aes(
      x = Distance,
      y = factor(Height),
      fill = Horizontal
    )) +
      geom_tile() +
      scale_fill_gradient(
        low = ifelse(!is.null(input$colorLow),
                     input$colorLow,
                     "#0000FF"),
        high = ifelse(!is.null(input$colorHigh),
                      input$colorHigh,
                      "#FF0000")
      ) +
      labs(
        title = "Heatmap of Horizontal Light Intensity",
        x = "Distance from Truck (ft)",
        y = "Height (in)",
        fill = "Intensity (Fc)"
      ) +
      theme_minimal()
  }, height = 400,
  width = 400)
  
  output$dataTable <- renderDT({
    datatable(filtered_data(), options = list(pageLength = 5))
  })
  
  js$colorInputBinding()
}

shinyApp(ui, server)

Другие вопросы по теме