Как предотвратить появление нескольких диалоговых окон подтверждения при закрытии форм в приложении WinForms?

Внимательно читая ваш код и элементы маркеров, я понимаю, что у вас есть основная форма для приложения и «несколько форм», которые могут отображаться одновременно и немодально, видимость которых может появляться и исчезать по усмотрению пользователя. Минимальный пример общего случая может выглядеть так:

Таким образом, вы можете поэкспериментировать с упрощением MainForm.OnFormClosing(), которое будет вызываться «любым» Application.Exit вызовом из любого места кода. Здесь не должно быть никакой необходимости проверять CloseReason, и, передав this в Show(this), это гарантирует, что дочерние формы останутся поверх основной формы в Z-порядке и удалятся, когда MainForm это сделает (как запишет отладочная запись ). Чтобы уточнить это, нет необходимости вызывать ApplicationExit() здесь, потому что, если закрывается основная форма, а подсказка не отменяет ее, приложение закроется.

public partial class MainForm : Form
{
    public MainForm()
    {
        InitializeComponent();            
        buttonShowFormA.Click += (sender, e) => _formA.Show(this);
        buttonShowFormB.Click += (sender, e) => _formB.Show(this);
        _formA.VisibleChanged += (sender, e) => buttonShowFormA.Enabled = !_formA.Visible;
        _formB.VisibleChanged += (sender, e) => buttonShowFormB.Enabled = !_formB.Visible;
#if DEBUG
        _formA.Disposed += (sender, e) => Debug.WriteLine("Disposing Form A");
        _formB.Disposed += (sender, e) => Debug.WriteLine("Disposing Form B");
#endif
    }
    ChildFormA _formA = new() { StartPosition = FormStartPosition.Manual };
    ChildFormB _formB = new () { StartPosition = FormStartPosition.Manual };
    protected override void OnLoad(EventArgs e)
    {
        base.OnLoad(e);
        _formA.Location = new() { X = Right + 10, Y = Top };
        _formB.Location = new() { X = Right + 10, Y = Top + _formA.Height + 10 };
        _formA.Show(this);
        _formB.Show(this);
    }
    protected override void OnFormClosing(FormClosingEventArgs e)
    {
        base.OnFormClosing(e);
        DialogResult result = MessageBox.Show("Are you sure you want to close the application?", "Confirm Exit", MessageBoxButtons.YesNo, MessageBoxIcon.Question);

        if (result == DialogResult.No)
        {
            e.Cancel = true; // Cancel the form closing
            return;
        }
    }
}

CloseReason важен в дочерних формах, так как нам нужно изменить поведение Form, при котором по умолчанию окно Handle перемещается при закрытии формы (что является большой проблемой, если вы хотите иметь возможность циклически повторять видимость дочерней формы).

Распространенный способ справиться с этим — отменить Close и вместо этого преобразовать его в форму Hide, разрешая только Close продолжить работу, это выход CloseReason is из приложения или какое-либо другое завершение работы системы.

public partial class ChildFormA : Form
{
    public ChildFormA()
    {
        InitializeComponent();
        buttonClose.Click += (sender, e) => Close();
        buttonExit.Click += (sender, e) => Application.Exit();
    }
    protected override void OnFormClosing(FormClosingEventArgs e)
    {
        base.OnFormClosing(e);
        switch (e.CloseReason)
        {
            case CloseReason.UserClosing:
                e.Cancel = true;
                Hide();
                break;
        }
    }
}

Надеемся, что этот базовый пример затронет большинство пунктов вашего вопроса. Установка указателя this при отображении других форм будет иметь большое значение для того, чтобы окна вели себя так, как вы ожидаете.

Я попытался воссоздать проблему, и ваш код работает отлично. Думаю, проблема в другом. Была ли форма входа в систему вашей формой запуска (основной)?

вот код, который совпадает с вашим, однако я пропустил

Application.Exit();

поскольку это не требуется, если вы на самом деле закрываете основную форму, однако, если вы вызываете ее из дочерней формы, это вызовет событие FormClosing в других формах, включая вход в систему (если он не основной)

public partial class Form1 : Form
{
    public Form1()
    {
        InitializeComponent();
    }

    protected override void OnFormClosing(FormClosingEventArgs e)
    {
        if (e.CloseReason == CloseReason.UserClosing)
        {
            DialogResult result = MessageBox.Show("Are you sure you want to close the application?", "Confirm Exit", MessageBoxButtons.YesNo, MessageBoxIcon.Question);

            if (result == DialogResult.No)
            {
                e.Cancel = true; // Cancel the form closing
                return;
            }
        }
    }
}