Как пронумеровать последовательности с одинаковым именем в файле кровати

У меня есть вот такая папка.

    KQ4156  0       34      Simple_repeat   .   +
    KQ4156  35      64      Simple_repeat   .   +
    KQ4156  1759    1822    Simple_repeat   .   +
    KQ4156  1901    2059    Simple_repeat   .   -
    KQ4156  2112    2258    DNA/hAT-Charlie .   +
    KQ4156  2890    2964    Simple_repeat   .   +
    KQ4156  4085    4130    DNA/hAT-Charlie .   +
    KQ4156  5587    5619    Simple_repeat   .   +
    KQ4156  5931    5995    SINE/tRNA-Deu   .   -

для последующего анализа мне нужно различать одни и те же элементы. э. simple_repeats_1, simple_repeats_2, и т. д. и DNA/hAT-Charlie_1, DNA/hAT-Charlie_2, и т. д.... для всех элементов. используется следующий сценарий:

awk 'BEGIN{OFS = "\t"}{if (NR>3) {if ($9= = "C"){strand = "-"}else{strand = "+"};print $5,$6-1,$7,$11,".",strand}}' file.fa.out > file.bed

как я могу изменить его, чтобы получить то, что я ищу? Думал применить paste но не знаю как применить для всех последовательностей