У меня есть фрейм данных с неуникальным MultiIndex:
A B
L1 L2
7.0 7.0 -0.4 -0.1
8.0 5.0 -2.1 1.6
5.0 8.0 -1.8 -0.8
7.0 7.0 0.5 -1.2
NaN -1.1 -0.9
5.0 8.0 0.6 2.3
Я хочу выбрать несколько строк, используя кортеж значений:
data = df.loc[(7, 7), :]
Неудивительно, что выдается предупреждение:
PerformanceWarning: indexing past lexsort depth may impact performance.
Я пытаюсь понять, что в текущем индексе вызывает это предупреждение. Я прочитал здесь много ответов, некоторые из них связаны со старыми версиями панд, другие помогли. Из того, что я прочитал, предупреждение вызвано двумя свойствами:
Итак, я обрабатываю индекс фрейма данных с помощью этой функции, созданной на основе ответов, найденных в этом стеке:
def adjust_index(df):
df = df.sort_index() # sort index
levels = list(range(len(df.index.levels)))
df_idx = df.groupby(level=levels).cumcount() # unique index
df_adj = df.set_index(df_idx, append=True) # change index
df_adj = df_adj.reset_index(level=-1, drop=True) # drop sorting level
return df_adj
Это не удаляет предупреждение. Можете ли вы объяснить, что не так, бесполезно или чего не хватает?
Остальная часть кода:
import pandas as pd
from numpy import nan, random as npr
npr.seed(2)
# Dataframe with unsorted MultiIndex
def create_df():
n_rows = 6
data = npr.randn(n_rows, 2).round(1)
choices = [8, 7, 5, 7, 8, nan]
columns = ['A', 'B']
levels = ['L1', 'L2']
tuples = list(zip(npr.choice(choices, n_rows), npr.choice(choices, n_rows)))
index = pd.MultiIndex.from_tuples(tuples, names=levels)
df = pd.DataFrame(data, index=index, columns=columns)
return df
df = create_df()
df = adjust_index(df)
data = df.loc[(7, 7), :] # <-- triggers warning
Я избавился от предупреждения, отсортировав индекс и поставив сначала значения NaN
:
df.sort_index(inplace=True, na_position = "first")
data = df.loc[(7, 7), :]
print(data)
Распечатки:
A B
L1 L2
7.0 7.0 -0.4 -0.1
7.0 0.5 -1.2
Я думаю, проблема в значении NaN
, которое у вас есть в index. В Pandas есть специальный index.codes
для каждого уникального значения индекса, а NaN
кодируется как -1
. Итак, чтобы отсортировать индекс, вам нужно иметь это значение -1
на первой позиции, следовательно na_position = "first"
Спасибо, я не смог найти это один.
@Timeless Да, это все еще было свежо в моей голове, поэтому я сначала начал смотреть
index.codes
:)