Как удалить слова из списка значений в определенном ключе словаря?

Почему не list понимание с dictионарным пониманием:

data = [{k:([' '.join([s for s in x.split() if s not in words]) for x in v] if k == 'ingredients' else v) for k, v in i.items()} for i in data]

В вашем подходе re.sub вы должны использовать map, а не filter (вы не отфильтровываете отдельные слова, а заменяете всю строку результатом re.sub)

for dct in data:
    dct['ingredients']= list(map(lambda x: regex.sub('', x), dct['ingredients']))

Или, возможно, более читаемо, как понимание списка:

    dct['ingredients'] = [regex.sub("", x) for x in dct['ingredients']]

Однако оба оставят лишние пробелы. Если слова всегда разделяются пробелом, вы можете просто использовать split и join (быстрее, если words является set):

for dct in data:
    dct['ingredients'] = [' '.join(w for w in string.split() if w not in words)
                          for string in dct['ingredients']]

words = ['cloves', 'packed']

data = [{'title': 'Simple Enchiladas Verdes',
         'prep_time': '15 min',
         'cook_time': '30 min',
         'ingredients': ['chicken breast', 'tomato sauce', 'garlic cloves', 'fresh packed cilantro']}
        ]
for i in data:
    word = ' @! '.join(i['ingredients'])
    for k in words:
        word = word.replace(k,'').strip()

    i['ingredients']=[i.strip() for i in word.split('@!')]

выход

[{'title': 'Simple Enchiladas Verdes',
  'prep_time': '15 min',
  'cook_time': '30 min',
  'ingredients': ['chicken breast',
   'tomato sauce',
   'garlic',
   'fresh  cilantro']}]

words = ['cloves', 'packed']

data = [{'title': 'Simple Enchiladas Verdes',
         'prep_time': '15 min',
         'cook_time': '30 min',
         'ingredients': ['chicken breast', 'tomato sauce', 'garlic cloves', 'fresh packed cilantro']
        },
        {'title': 'Simple Enchiladas Verdes11',
         'prep_time': '15 min11',
         'cook_time': '30 min11',
         'ingredients': ['chicken breast1', '1tomato sauce', '1garlic cloves', '1fresh packed cilantro']}
        ]

n = []
for d in data:
    for item in d['ingredients']:
        for word in words:
            item = item.replace(word, '')
        n.append(item)
    d['ingredients'] = n

print (d)

выход:

{'title': 'Simple Enchiladas Verdes11', 'prep_time': '15 min11', 'cook_time': '30 min11', 'ingredients': ['chicken breast', 'tomato sauce', 'garlic ', 'fresh  cilantro', 'chicken breast1', '1tomato sauce', '1garlic ', '1fresh  cilantro']}