Как установить переменную tmp disk в nextflow

Я хочу добавить значение tmp disk в мой процесс nextflow.

Требования к процессору и памяти настроены, но как добавить значение tmp disk? Данные важны планировщику (slurm) для выбора подходящего узла.

Облако заголовков процесса nextflow будет:

process TEST {
  echo true
  cpus '8'
  memory '40 GB'
  script:
    """
    """
}

Это значение вызывается в slurm tmp disk, его можно просмотреть с помощью squeue -o "%C %m %d", столбец MIN_TMP_DISK.

Если какая-либо информация отсутствует, пожалуйста, дайте мне знать.

Спасибо

Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
1
0
27
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Вы можете использовать директиву процесса Параметры кластера с исполнителем ГРЯЗЬ. Судя по документам отрывок, вы ищете вариант --tmp:

--tmp=[units]

Specify a minimum amount of temporary disk space per node. Default units are megabytes. Different units can be specified using the suffix [K|M|G|T].

Например:

process TEST {

    debug true

    clusterOptions '--tmp=1T'

    cpus 8
    memory 40.GB

    """
    echo "Hello world"
    """
}

Другие вопросы по теме