Любая поддержка в Spring Batch для чтения нескольких файлов в zip

Вы можете попробовать использовать Partitioner для получения данных из нескольких файлов.

https://docs.spring.io/spring-batch/docs/current/reference/html/scalability.html#partitioning

Или https://docs.spring.io/spring-framework/docs/4.0.0.RELEASE/javadoc-api/org/springframework/core/io/support/PathMatchingResourcePatternResolver.html

https://docs.spring.io/spring-batch/docs/current/api/org/springframework/batch/item/file/MultiResourceItemReader.html

public class CustomMultiResourcePartitioner implements Partitioner {
 
    @Override
    public Map<String, ExecutionContext> partition(int gridSize) {
        Map<String, ExecutionContext> map = new HashMap<>(gridSize);
        int i = 0, k = 1;
        for (Resource resource : resources) {
            ExecutionContext context = new ExecutionContext();
            Assert.state(resource.exists(), "Resource does not exist: " 
              + resource);
            context.putString(keyName, resource.getFilename());
            context.putString("opFileName", "output"+k+++".xml");
            map.put(PARTITION_KEY + i, context);
            i++;
        }
        return map;
    }
}