MySQL - выберите отдельное значение из двух столбцов

Это на самом деле интересная проблема. Если я правильно понял вас, вы хотите перебрать набор данных и сохранить только те строки, в которых оба значения никогда раньше не встречались. Вы можете использовать рекурсивный запрос:

with recursive 
    data as (
        select idm, ids, row_number() over(order by idm, ids) rn 
        from mytable 
        where idm <> ids
    ),
    cte as (
        select idm, ids, rn, 1 as to_keep , concat(idm, ',', ids) visited from data where rn = 1
        union all
        select d.idm, d.ids, d.rn,
            (not find_in_set(d.idm, c.visited) and not find_in_set(d.ids, c.visited)),
            case when (not find_in_set(d.idm, c.visited) and not find_in_set(d.ids, c.visited))
                then concat_ws(',', c.visited, d.idm, d.ids)
                else c.visited
            end
        from cte c
        inner join data d on d.rn = c.rn + 1
    )
select idm, ids from cte where to_keep

Первый CTE перечисляет строки, упорядоченные по обоим столбцам. Затем рекурсивный запрос просматривает набор результатов, проверяет, являются ли оба значения новыми, и устанавливает соответствующий флаг для столбцов. Помеченные номера сохраняются для использования при фильтрации в следующей итерации.

Демо на DB Fiddle

Обратите внимание, что, учитывая ваше требование, не все значения могут отображаться в наборе результатов. Рассмотрим следующий набор данных:

 idm   ids
+-----+---
 1     2
 1     3
 1     4

Ваша логика вернет только первую строку.