Недопустимая ошибка флага при использовании bash для компиляции java

Вот проблема, которую вы видите:

$ cat compile.sh
javac Main.java

$ bash compile.sh
javac: invalid flag: Main.java
Usage: javac <options> <source files>
use -help for a list of possible options

Это происходит потому, что скрипт использует окончания строк в стиле DOS:

$ cat -v compile.sh
javac Main.java^M

Вы можете исправить это, настроив редактор для сохранения с разделителями строк Unix или, например, с помощью tr:

$ tr -d '\r' < compile.sh > fixed.sh
(no output)

$ cat -v fixed.sh
javac Main.java

Теперь он работает так, как ожидалось:

$ bash fixed.sh
(no output)