Networkx KeyError: «источник» с from_pandas_edgelist для ненаправленного списка краев

Да, для создания ненаправленной сети из фрейма данных необходимо указать источник и цель.

Не обязательно, но чтобы граф был неориентированным, можно указать create_using kwarg:

from networkx import Graph, from_pandas_edgelist

df = ...

# note that Graph is the default setting, so specifying
# create_using=Graph is optional
G = from_pandas_edgelist(df, "topic", "neighbor", create_using=Graph)


print(G.is_directed())
# False

Попробуй это:

import pandas as pd
import networkx as nx

df = pd.read_clipboard()
print(df)

Вывод:

  topic neighbor
0     K       Kl
1     K       Pr
2    Kl       TS
3    Pr       Kl
4    Pr       Pr

Используйте параметры source и target:

G = nx.from_pandas_edgelist(df, source='topic', target='neighbor')
nx.draw_networkx(G)

Вывод: