Невозможно создать хранимую процедуру через конвейер Azure

Ошибка сообщает вам о проблеме: в вашем коде есть синтаксические ошибки; множество синтаксических ошибок.

По правде говоря, нет необходимости в синтаксисе, который вы используете (проверка существования процесса и последующее выполнение CREATE в отложенном пакете). Все поддерживаемые версии SQL Server допускают синтаксис CREATE OR ALTER, и вы используете базу данных SQL Azure, основанную на последней версии подсистемы данных (а иногда и на следующей).

Так что просто используйте CREATE OR ALTER (и избавьтесь от префикса sp_):

CREATE OR ALTER PROCEDURE dbo.checknpapermission
AS BEGIN
    SET NOCOUNT ON;
    DECLARE @UserName nvarchar(128);
    DECLARE user_cursor CURSOR FOR
        SELECT name
        FROM sys.database_principals
        WHERE name LIKE '%@web.onmicrosoft.com'
          AND type_desc = 'EXTERNAL_USER';

    BEGIN TRY
        OPEN user_cursor;
        FETCH NEXT FROM user_cursor
        INTO @UserName;

        WHILE @@FETCH_STATUS = 0 BEGIN
            IF NOT EXISTS (SELECT 1
                           FROM sys.database_role_members rm
                                JOIN sys.database_principals r ON rm.role_principal_id = r.principal_id
                                JOIN sys.database_principals u ON rm.member_principal_id = u.principal_id
                           WHERE u.name = @UserName
                             AND r.name = 'db_owner') BEGIN
                PRINT 'The user ' + @UserName + ' does not have db_owner role';
            END;
            ELSE BEGIN
                PRINT 'The user ' + @UserName + ' already has the db_owner role';
            END;
            FETCH NEXT FROM user_cursor
            INTO @UserName;
        END;

        CLOSE user_cursor;
        DEALLOCATE user_cursor;
    END TRY
    BEGIN CATCH
        ROLLBACK; --Why is this here...?
        PRINT ERROR_MESSAGE();
    END CATCH;
END;

А еще лучше выбросьте это CURSOR; это будет ужасно медленно. Мы также можем избавиться от ошибок TRY...CATCH и ROLLBACK (что вы здесь пытаетесь откатить?), а ошибки PRINT — это антишаблон. Вы можете легко добиться тех же результатов с помощью простой агрегации строк.

CREATE OR ALTER PROCEDURE dbo.checknpapermission
AS BEGIN
    SET NOCOUNT ON;

    DECLARE @PrintStatement varchar(8000),
            @LF char(1) = CHAR(10)

    SELECT @PrintStatement = STRING_AGG('The user ' + u.name + ' ' + CASE WHEN r.principal_id IS NULL THEN 'does not have the db_owner role'
                                                                          ELSE 'already has the db_owner role' END, @LF)
    FROM sys.database_principals u
         LEFT JOIN sys.database_role_members rm
              JOIN sys.database_principals r ON rm.role_principal_id = r.principal_id
                                             AND r.name = 'db_owner'
                                             ON u.principal_id = rm.member_principal_id
    WHERE u.name LIKE '%@web.onmicrosoft.com'
      AND u.type_desc = 'EXTERNAL_USER';

    PRINT @PrintStatement;

END;