Nextflow: канал From Path возвращает null, даже если файл существует
Я хотел создать канал с определенными файлами, как показано ниже:
nextflow.enable.dsl=1
channel.FromPath('/cluster/projects/p33/users/gledak/metabolomics/lipids/out/*_permuted*.glm.linear').view()
Но это дает мне ошибку:
Cannot invoke method view() on null object
Любая помощь?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
1
0
61
1
Перейти к ответу
Данный вопрос помечен как решенный
Ответы 1
Ответ принят как подходящий
Методы фабрики каналов (например, fromPath) и операторы следуют соглашению об именах в нижнем регистре. Что вы хотите:
Channel.fromPath('/cluster/projects/p33/users/gledak/metabolomics/lipids/out/*_permuted*.glm.linear').view()
Обратите внимание, что старый DSL1 больше не поддерживается.
Другие вопросы по теме
Выходной файл захвата Nextflow по частичному шаблону
Nextflow переименовывает штрих-коды и объединяет считывания в штрих-кодах
Проблема Nextflow Docker - проблема с разрешением в Docker? Не удается запустить контейнер pomoxis
Как преобразовать цикл в Job-массив в кластере LSF
Как сохранить множественный вывод одного процесса в publishDir в Nextflow
Проблема с конфигурационным файлом Nextflow
ОШИБКА nextflow.cli.Launcher — @unknown в Nextflow
Доступ и изменение одного элемента кортежа в Nextflow/Groovy Channel
Передача списка имен файлов в процесс nextflow
Получение странной ошибки при запуске конвейера nextflow
Похожие вопросы
Как вызвать сценарий bash в следующем потоке и управлять несколькими входами
Nextflow не загружает «последний» образ Docker
Выходной файл не создается при запуске команды R в файле Nextflow?
Nextflow DSL2: как объединить выходные данные (каналы) из нескольких процессов во входные данные другого процесса по части имени файла?
Как мне обрабатывать файлы с совпадающим шаблоном в nextflow?
Как передать вывод из одного канала Nextflow в другой и запустить файл .Rmd?
Выходные данные Nextflow DSL2 из разных процессов перепутаны с входными данными для более поздних процессов
Проблема baseDir с nextflow
Преобразование каналов в строки в Nextflow DSL2
Nextflow: разделить или подмножить канал, содержащий кортежи