Я работаю с позициями частиц в разных массивах, что-то вроде (три частицы):
import numpy as np
x = np.array([1, 2, 3])
y = np.array([2, 6, 1])
z = np.array([0, 3, 6])
Я делаю это таким образом из-за 3D-графиков matplotlib, которые требуют наличия разных координат в разных массивах (например, ax.scatter(x, y, z)).
Но недостатком этого подхода является то, что если я хочу перемножить матрицы:
mat = np.array([[10, 0, 0], [0, 10, 0], [0, 0, 10]])
Я не могу использовать np.dot напрямую, потому что координаты находятся в разных массивах, поэтому мне нужно объединить их и разъединить после умножения. Я знаю, как это сделать (np.transpose([x, y, z])), но меня беспокоит эффективность, я не знаю, сложны ли эти операции для больших массивов (я работаю с сотнями тысяч или миллионами частиц). Возможно, для этого есть функция numpy, о которой я не знаю. Конечно, реализовать это самостоятельно не составит труда.






Я предполагаю, что вам нужно отображать свои точки и/или результаты всего несколько раз в рамках всей вашей системы. По крайней мере, так обычно бывает по моему собственному опыту. Учитывая это, вы можете выполнить все свои вычисления на одной матрице, содержащей все ваши точки, поскольку это НАМНОГО более эффективно. Позже, когда вам понадобится что-то построить, вы можете разделить матрицу на отдельные точки и продолжить. Поскольку построение графиков происходит гораздо реже по сравнению с вычислениями, этими затратами можно пренебречь.
Вы можете избежать проблемы XY, используя
ax.scatter(*xyz.T)вместо xyz(N, 3).