У меня есть датафрейм df.sample
вот так
id <- c("A","A","A","A","A","A","A","A","A","A","A")
date <- c("2018-11-12","2018-11-12","2018-11-12","2018-11-12","2018-11-12",
"2018-11-12","2018-11-12","2018-11-14","2018-11-14","2018-11-14",
"2018-11-12")
hour <- c(8,8,9,9,13,13,16,6,7,19,7)
min <- c(47,59,6,18,22,36,12,32,12,21,47)
value <- c(70,70,86,86,86,74,81,77,79,83,91)
df.sample <- data.frame(id,date,hour,min,value,stringsAsFactors = F)
df.sample$date <- as.Date(df.sample$date,format = "%Y-%m-%d")
У меня есть еще один фрейм данных df.state
вот такой
id <- c("A","A","A")
starttime <- c("2018-11-12 08:59:00","2018-11-14 06:24:17","2018-11-15 09:17:00")
endtime <- c("2018-11-12 15:57:00","2018-11-14 17:22:16","2018-11-15 12:17:32")
state <- c("Pass","Pass","Pass")
df.state <- data.frame(id,starttime,endtime,state,stringsAsFactors = F)
df.state$starttime <- as.POSIXct(df.state$starttime,format = "%Y-%m-%d %H:%M:%S")
df.state$endtime <- as.POSIXct(df.state$endtime,format = "%Y-%m-%d %H:%M:%S")
Я пытаюсь объединить эти 2 фрейма данных на основе условия
если hour
и min
в df.sample
находятся внутри starttime
и endtime
в df.state
, то объедините state = Pass
в df.sample
.
Например, строка 2 в df.sample
содержит hour = 8
, min = 59
, и поскольку она находится внутри starttime = 2018-11-12 08:59:00
в df.state
, добавляется значение Pass
.
Вот мой желаемый результат
id date hour min value state
A 2018-11-12 8 47 70
A 2018-11-12 8 59 70 Pass
A 2018-11-12 9 6 86 Pass
A 2018-11-12 9 18 86 Pass
A 2018-11-12 13 22 86 Pass
A 2018-11-12 13 36 74 Pass
A 2018-11-12 16 12 81
A 2018-11-14 6 32 77 Pass
A 2018-11-14 7 12 79 Pass
A 2018-11-14 19 21 83
A 2018-11-12 7 47 91
Я могу объединить эти 2 фрейма данных, как это, но не могу найти час и минуту df.sample в начальное и конечное время df.state
library(tidyverse)
df.sample <- df.sample %>%
left_join(df.state)
Может ли кто-нибудь указать мне в правильном направлении
(Важное предварительное примечание: as.POSIXct
создает значения POSIXct с местным часовым поясом, тогда как lubridate::ymd
создает время UTC. Вы получите неожиданные результаты, если часовые пояса различаются в вашем соединении ниже.)
df.state$starttime <- lubridate::ymd_hms(df.state$starttime)
df.state$endtime <- lubridate::ymd_hms(df.state$endtime)
Это можно сделать с помощью fuzzyjoin:
library(fuzzyjoin)
df.sample %>%
mutate(sample_time = lubridate::ymd_hm(paste(date, hour, min))) %>%
fuzzy_left_join(df.state,
by = c("id" = "id",
"sample_time" = "starttime",
"sample_time" = "endtime"),
match_fun = list(`==`, `>=`, `<=`))
id.x date hour min value sample_time id.y starttime endtime state
1 A 2018-11-12 8 47 70 2018-11-12 08:47:00 <NA> <NA> <NA> <NA>
2 A 2018-11-12 8 59 70 2018-11-12 08:59:00 A 2018-11-12 08:59:00 2018-11-12 15:57:00 Pass
3 A 2018-11-12 9 6 86 2018-11-12 09:06:00 A 2018-11-12 08:59:00 2018-11-12 15:57:00 Pass
4 A 2018-11-12 9 18 86 2018-11-12 09:18:00 A 2018-11-12 08:59:00 2018-11-12 15:57:00 Pass
5 A 2018-11-12 13 22 86 2018-11-12 13:22:00 A 2018-11-12 08:59:00 2018-11-12 15:57:00 Pass
6 A 2018-11-12 13 36 74 2018-11-12 13:36:00 A 2018-11-12 08:59:00 2018-11-12 15:57:00 Pass
7 A 2018-11-12 16 12 81 2018-11-12 16:12:00 <NA> <NA> <NA> <NA>
8 A 2018-11-14 6 32 77 2018-11-14 06:32:00 A 2018-11-14 06:24:17 2018-11-14 17:22:16 Pass
9 A 2018-11-14 7 12 79 2018-11-14 07:12:00 A 2018-11-14 06:24:17 2018-11-14 17:22:16 Pass
10 A 2018-11-14 19 21 83 2018-11-14 19:21:00 <NA> <NA> <NA> <NA>
11 A 2018-11-12 7 47 91 2018-11-12 07:47:00 <NA> <NA> <NA> <NA>
Использование неэквивалентного соединения из пакета data.table
намного быстрее и проще, если у вас есть большие фреймы данных:Ориентир | видео
library(data.table)
## convert both data.frames to data.tables by reference
setDT(df.sample)
setDT(df.state)
## create a `time` column in df.sample
df.sample[, time := as.POSIXct(paste0(date, " ", hour, ":", min, ":00"))]
## change column order
setcolorder(df.sample, c("id", "time"))
# join by id and time within start & end time limits
# "x." is used so we can refer to the column in other data.table explicitly
df.state[df.sample, .(id, time, date, hour, min, value, state = x.state),
on = .(id, starttime <= time, endtime >= time)]
#> id time date hour min value state
#> 1: A 2018-11-12 08:47:00 2018-11-12 8 47 70 <NA>
#> 2: A 2018-11-12 08:59:00 2018-11-12 8 59 70 Pass
#> 3: A 2018-11-12 09:06:00 2018-11-12 9 6 86 Pass
#> 4: A 2018-11-12 09:18:00 2018-11-12 9 18 86 Pass
#> 5: A 2018-11-12 13:22:00 2018-11-12 13 22 86 Pass
#> 6: A 2018-11-12 13:36:00 2018-11-12 13 36 74 Pass
#> 7: A 2018-11-12 16:12:00 2018-11-12 16 12 81 <NA>
#> 8: A 2018-11-14 06:32:00 2018-11-14 6 32 77 Pass
#> 9: A 2018-11-14 07:12:00 2018-11-14 7 12 79 Pass
#> 10: A 2018-11-14 19:21:00 2018-11-14 19 21 83 <NA>
#> 11: A 2018-11-12 07:47:00 2018-11-12 7 47 91 <NA>
### remove NA
df.state[df.sample, .(id, time, date, hour, min, value, state = x.state),
on = .(id, starttime <= time, endtime >= time), nomatch = 0L]
#> id time date hour min value state
#> 1: A 2018-11-12 08:59:00 2018-11-12 8 59 70 Pass
#> 2: A 2018-11-12 09:06:00 2018-11-12 9 6 86 Pass
#> 3: A 2018-11-12 09:18:00 2018-11-12 9 18 86 Pass
#> 4: A 2018-11-12 13:22:00 2018-11-12 13 22 86 Pass
#> 5: A 2018-11-12 13:36:00 2018-11-12 13 36 74 Pass
#> 6: A 2018-11-14 06:32:00 2018-11-14 6 32 77 Pass
#> 7: A 2018-11-14 07:12:00 2018-11-14 7 12 79 Pass
Created on 2019-05-23 by the reprex package (v0.3.0)
Это можно сделать, сначала добавив столбец времени в ваш df.sample
data.frame, а затем выполнив оценку на основе ваших критериев, используя sapply
и добавив этот результат в df.sample
df.sample$time <- paste0(df.sample$date, ' ', sprintf('%02d', df.sample$hour),':', sprintf('%02d', df.sample$min), ':00')
df.sample$state <- sapply(df.sample$time, function(x) {
after_start <- x >= df.state$starttime
before_end <- x <= df.state$endtime
y <- cbind(after_start, before_end)
pass_check <- apply(y, 1, sum)
if (2 %in% pass_check) {'PASS'} else {''}
})
df.sample
id date hour min value time state
1 A 2018-11-12 8 47 70 2018-11-12 08:47:00
2 A 2018-11-12 8 59 70 2018-11-12 08:59:00 PASS
3 A 2018-11-12 9 6 86 2018-11-12 09:06:00 PASS
4 A 2018-11-12 9 18 86 2018-11-12 09:18:00 PASS
5 A 2018-11-12 13 22 86 2018-11-12 13:22:00 PASS
6 A 2018-11-12 13 36 74 2018-11-12 13:36:00 PASS
7 A 2018-11-12 16 12 81 2018-11-12 16:12:00
8 A 2018-11-14 6 32 77 2018-11-14 06:32:00 PASS
9 A 2018-11-14 7 12 79 2018-11-14 07:12:00 PASS
10 A 2018-11-14 19 21 83 2018-11-14 19:21:00
11 A 2018-11-12 7 47 91 2018-11-12 07:47:00
Что я сделал, так это извлек десятичный час из каждого предоставленного вами фрейма данных, чтобы я мог спросить, найдено ли значение в этом десятичном часе. Но сначала вам нужно объединить наборы данных на основе идентификатора (при условии, что у вас есть другие идентификаторы) и даты (при условии, что в день существует только одно состояние или, другими словами, одна дата существует в день в наборе данных df.state).
id <- c("A","A","A","A","A","A","A","A","A","A","A")
date <- c("2018-11-12","2018-11-12","2018-11-12","2018-11-12","2018-11-12",
"2018-11-12","2018-11-12","2018-11-14","2018-11-14","2018-11-14",
"2018-11-12")
hour <- c(8,8,9,9,13,13,16,6,7,19,7)
min <- c(47,59,6,18,22,36,12,32,12,21,47)
value <- c(70,70,86,86,86,74,81,77,79,83,91)
df.sample <- data.frame(id,date,hour,min,value,stringsAsFactors = F)
df.sample$date <- as.Date(df.sample$date,format = "%Y-%m-%d")
df.sample$dec.hour <- as.numeric(df.sample$hour) +
as.numeric(df.sample$min)/60
Все, что я добавил выше, - это последние несколько строк для расчета десятичного часа из предоставленных вами значений часа и минуты.
id <- c("A","A","A")
starttime <- c("2018-11-12 08:59:00","2018-11-14 06:24:17","2018-11-15 09:17:00")
endtime <- c("2018-11-12 15:57:00","2018-11-14 17:22:16","2018-11-15 12:17:32")
state <- c("Pass","Pass","Pass")
df.state <- data.frame(id,starttime,endtime,state,stringsAsFactors = F)
Здесь я добавил вектор даты (для слияния). Я произвольно выбрал время начала, предполагая, что даты начала и окончания всегда одинаковы.
df.state$date <- as.Date(df.state$starttime,format = "%Y-%m-%d")
Затем я получаю десятичный час для времени начала и окончания в эту дату.
t.str <- strptime(df.state$starttime, "%Y-%m-%d %H:%M:%S")
df.state$dec.hour.start <- as.numeric(format(t.str, "%H")) +
as.numeric(format(t.str, "%M"))/60
t.end <- strptime(df.state$endtime, "%Y-%m-%d %H:%M:%S")
df.state$dec.hour.end <- as.numeric(format(t.end, "%H")) +
as.numeric(format(t.end, "%M"))/60
объединить кадры данных по идентификатору и дате
df<-merge(df.sample, df.state, by=c("id","date"))
если десятичный час выборки находится в пределах начального или конечного десятичного часа (для этой даты), то возвращает TRUE для состояния.
df<-df %>%
mutate(state = dec.hour >= dec.hour.start & dec.hour <= dec.hour.end)
Теперь, если вы хотите избавиться от всех этих дополнительных столбцов, которые я создал (так что это выглядит как желаемый результат):
df<-df[,-c(6:8,10:11)]
Поскольку df$state логичен, вам нужно сначала преобразовать значения в символы, если вы хотите изменить TRUE на проход, а FALSE на пробел:
df$state<-as.character(df$state)
df$state[df$state= = "TRUE"]<-"pass"
df$state[df$state= = "FALSE"]<-""
Посмотри:
df
> df
id date hour min value state
1 A 2018-11-12 8 47 70
2 A 2018-11-12 8 59 70 pass
3 A 2018-11-12 9 6 86 pass
4 A 2018-11-12 9 18 86 pass
5 A 2018-11-12 13 22 86 pass
6 A 2018-11-12 13 36 74 pass
7 A 2018-11-12 16 12 81
8 A 2018-11-12 7 47 91
9 A 2018-11-14 6 32 77 pass
10 A 2018-11-14 7 12 79 pass
11 A 2018-11-14 19 21 83
Я использовал этот пост: извлекать часы и секунды из POSIXct для построения графиков в R для извлечения десятичных часов и этот: Проверить, находится ли значение в диапазоне?, чтобы увидеть, было ли время выборки в пределах времени вашего состояния.
Этот один сравнивает
dplyr
иdata.table
при выполнении неэквивалентного соединения для кадров больших данных.