Ошибка компиляции при установке пакетов после обновления до R 4.4 в Ubuntu 22.04

Итак, я только что обновился до R 4.4. Для справки, я использую Ubuntu 22.04. Следующим шагом была переустановка всех моих пакетов. Дело в том, что многие из них получают одну и ту же ошибку. Например, при попытке установить «vroom»

install.packages("vroom")

При установке пакета я обычно получаю очень длинный текст, но он заканчивается ошибкой:

cc1plus: some warnings being treated as errors
make: *** [/usr/lib/R/etc/Makeconf:202 : delimited_index.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘vroom’
* removing ‘/home/username/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.4/vroom’

Итак, я понял, что это ошибка компиляции C++. Я ничего не знаю о C++.

Я нашел в сети людей с похожими ошибками, которые следовали шаблону make: *** [text] Error 1, и люди предлагали переустановить пакет Rcpp. Я сделал это с помощью функции install.packages(), и с установкой проблем не возникло. Но моя проблема с установкой других пакетов, таких как vroom, осталась прежней.

Есть ли у вас идеи, как решить эту проблему, или я обречен удалить R и вернуться к 4.3?

Спасибо за ваше время

Обновлено: Вот как выглядят предупреждения.

/usr/lib/R/site-library/cpp11/include/cpp11/protect.hpp:337:42: warning: format ‘%x’ expects argument of type ‘unsigned int’, but argument 5 has type ‘SEXP’ {aka ‘SEXPREC*’} [-Wformat=]
  337 |       REprintf("%x CAR: %x CDR: %x TAG: %x\n", head, CAR(head), CDR(head), TAG(head));
      |                                         ~^                                 ~~~~~~~~~
      |                                          |                                    |
      |                                          unsigned int                         SEXP {aka SEXPREC*}

Насколько я понимаю, они все выглядят одинаково. Единственное, что меняется, это цифры после protect.hpp:. Предупреждение появляется для аргументов со 2 по 5.

Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
3
0
808
2
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 2

Ответ принят как подходящий

То же самое произошло со мной в Debian Bookworm. Я устанавливал vroom для установки tidyverse. Этот пост здесь помог найти решение, и пока оно работает.

По сути, удалите все ссылки на «-Werror=format-security» в файле /etc/R/Makeconf (вам потребуются права администратора). Сохраните его и переустановите vroom/tidyverse.

Однако я не могу сказать, является ли это критической проблемой, поэтому после установки я восстановил файл Makeconf в исходном виде.

У меня была такая же проблема на Debian 12, R 4.4.0 и cpp11 0.4.7 (все последние версии на момент написания этого комментария).
Я следил за обсуждением здесь, в котором предлагалось обновить пакет с именем progress до 1.2.3, и это сработало.

Другие вопросы по теме