Ошибка при применении функции readRDS к соединению Arvados Collection в R

Я получаю сообщение об ошибке, когда пытаюсь прочитать объект R из файла RDS, расположенного на платформе Arvados. Во-первых, я использую следующий код для подключения к Arvados и получения списка файлов:

library('ArvadosR')

# Read ARVADOS_API_TOKEN and ARVADOS_API_HOST
readRenviron("~/.config/arvados/arv.conf")

# Connect to Arvados
arv = Arvados$new()

# Get collection object
coll = Collection$new(arv, "<collection_uuid>")

# List collection content
coll$getFileListing()

Когда я читаю файл с разделителями табуляции xyz.txt с

df.a = read.delim(coll$get("xyz.txt")$connection("r"))

он отлично работает. Однако, когда я пытаюсь прочитать файл RDS abc.RDS с помощью

df.b = readRDS(coll$get("abc.RDS")$connection("r"))

Я получаю следующую ошибку:

Error in readRDS(coll$get("abc.RDS")$connection("r")) : 
   unknown input format

Чтение abc.RDS с локального диска работает нормально. Согласно странице справки, readRDS принимает «соединение или имя файла, в котором объект R сохраняется или читается».

Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
0
0
63
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Я мог заставить это работать с readRDS(gzcon(coll$get("abc.RDS")$connection("rb"))).

В help(readRDS) я заметил этот абзац:

«Сжатие обрабатывается соединением, открытым, когда file является именем файла, поэтому возможно только тогда, когда file является соединением, если оно обрабатывается соединением. Так, например, соединения url необходимо обернуть вызовом gzcon».

Другие вопросы по теме