Переименовать факторную переменную в мульти ggboxplot

Самый простой способ сделать это — передать версию ваших данных с измененными именами столбцов.

Следующее довольно хорошо воспроизводит вашу собственную настройку:

library(ggpubr)

set.seed(1)

d <- data.frame(Condition.Name = rep(c("Breakfast", "No Breakfast"), 100),
                pun = rnorm(200, 100, 10),
                mv = rnorm(200, 98, 10))

Таким образом, используя ваш собственный код построения графика, мы получаем график, аналогичный вашему:

ggboxplot(d, x = "Condition.Name", 
y = c("pun", "mv"),
combine = TRUE,
color = c("#0073C2FF", "#EFC000FF", "#0073C2FF", "#EFC000FF"),
xlab = 'Condition',
ylab = 'Total score'
)

Чтобы изменить его, мы просто переименовываем столбцы в копии d, которую мы передаем в ggboxplot. Самый простой способ сделать это, вероятно, с помощью dplyr::rename:

ggboxplot(dplyr::rename(d, Punishment = pun, Morality = mv), 
          x = "Condition.Name", 
          y = c("Punishment", "Morality"),
          combine = TRUE,
          color = c("#0073C2FF", "#EFC000FF", "#0073C2FF", "#EFC000FF"),
          xlab = 'Condition',
          ylab = 'Total score'
)

^{Created on 2020-12-14 by the reprex package (v0.3.0)}