Почему я могу выйти из цикла while?

Я новичок в python и пытаюсь написать функцию python, которая генерирует случайные n-меры (каждый символ может быть одним из (ACGT) в конце. Но цикл while, кажется, продолжается вечно. Любые предложения? Вот мой код:

def add_base(x):

    random_seqs = []
    for char in "ACGT":
        y = x + char
        random_seqs.append(y)
    return random_seqs


def random_n_mer(n):

    print("Random " + str(n) + " mers")
    i = 1

    random_mers_next = []
    random_mers = add_base("")

    while i < n:

        for base in random_mers:
            print(base)
            random_mers_next.extend(add_base(base))
            print(random_mers)
            print(random_mers_next)
        random_mers = random_mers_next
        i = i+1

random_n_mer(3)

Было бы легче понять, что здесь не так, если бы вы могли переформатировать код, чтобы показать фактический отступ.

Lancelot du Lac 23.04.2022 09:35
Анализ настроения постов в Twitter с помощью Python, Tweepy и Flair
Анализ настроения постов в Twitter с помощью Python, Tweepy и Flair
Анализ настроения текстовых сообщений может быть настолько сложным или простым, насколько вы его сделаете. Как и в любом ML-проекте, вы можете выбрать...
7 лайфхаков для начинающих Python-программистов
7 лайфхаков для начинающих Python-программистов
В этой статье мы расскажем о хитростях и советах по Python, которые должны быть известны разработчику Python.
Установка Apache Cassandra на Mac OS
Установка Apache Cassandra на Mac OS
Это краткое руководство по установке Apache Cassandra.
Сертификатная программа "Кванты Python": Бэктестер ансамблевых методов на основе ООП
Сертификатная программа "Кванты Python": Бэктестер ансамблевых методов на основе ООП
В одном из недавних постов я рассказал о том, как я использую навыки количественных исследований, которые я совершенствую в рамках программы TPQ...
Создание персонального файлового хранилища
Создание персонального файлового хранилища
Вы когда-нибудь хотели поделиться с кем-то файлом, но он содержал конфиденциальную информацию? Многие думают, что электронная почта безопасна, но это...
Создание приборной панели для анализа данных на GCP - часть I
Создание приборной панели для анализа данных на GCP - часть I
Недавно я столкнулся с интересной бизнес-задачей - визуализацией сбоев в цепочке поставок лекарств, которую могут просматривать врачи и...
2
1
43
2
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 2

Причина, по которой ваш цикл while продолжается вечно, заключается в том, что вы установили для своей переменной random_mers значение random_mers_next. Внутри цикла for для функции random_n_mer(n) вы расширяете random_mers_next, делая список длиннее. После этого вы говорите, что random_mers равно этому списку. Поскольку цикл for перебирает каждое значение в списке random_mers, и вы продолжаете добавлять в этот список, он никогда не закончится.

Спасибо Алану. Я бы подумал, что в цикле while каждая итерация выполняет все шаги до последнего шага (то есть i += 1), прежде чем начнется следующая итерация (начиная с цикла for). «random_mers = random_mers_next» — это второй шаг вне цикла for. Но похоже, что он автоматически возвращает значение в цикл for перед выполнением i+=1?

Yan 25.04.2022 04:19

Да, это правильно. Он будет передавать значение в цикл for каждый раз, что приводит к тому, что он никогда не заканчивается.

Alan Shiah 25.04.2022 04:22
Ответ принят как подходящий

Я рискну и угадаю:

ты пропускаешь

random_mers_next = []

Итак, попробуйте следующее:

while i < n:

    for base in random_mers:
        print(base)
        random_mers_next.extend(add_base(base))
        print(random_mers)
        print(random_mers_next)
    random_mers = random_mers_next
    random_mers_next = []
    i = i+1

Без него вы быстро расширяете random_mers — на каждой i итерации вы дважды обрабатываете ранее созданные элементы, что добавляет экспоненциальный рост к 4-кратному росту самого алгоритма.

Это сработало блестяще. Спасибо, Радослав. Но у меня все еще есть тот же вопрос, который я задал выше Алану....

Yan 25.04.2022 04:27

Другие вопросы по теме