Подсчет подходящих минут с часами как группа -python

IIUC, вы можете использовать divmod, чтобы получить деление и остаток на 60 и добавить недостающие строки с помощью pandas.concat:

s1,s2 = df['minutes'].divmod(60)
(pd
 .concat([df,
          # select rows where hour is multiple of 60
          # and matching hour is not already the previous hour
                                          # decrement hour
          df[s1.ne(df['hour']-1)&s2.eq(0)].eval('hour = hour-1')
          ])
 .groupby('hour')
 .agg({'hour': 'first', 'minutes': 'count'})
)

Или, если вы уже знаете, что часы и минуты совпадают, упростите, используя только mod:

mask = df['minutes'].mod(60).eq(0)
(pd
 .concat([df,
          df[mask].eval('hour = hour-1')
          ])
 .groupby('hour')
 .agg({'hour': 'first', 'minutes': 'count'})
)

выход:

      hour  minutes
hour               
12      12        3
13      13        4