Python получает SettingWithCopyWarning - iloc против loc - не может понять, почему

У меня есть базовое понимание SettingWithCopyWarning, но я не могу понять, почему я получаю предупреждение для этого конкретного случая.

Я следую коду из https://github.com/ageron/handson-ml/blob/master/02_end_to_end_machine_learning_project.ipynb

Когда я запускаю код, как показано ниже (используя .loc), я не получаю SettingWithCopyWarning

Однако, если вместо этого я запускаю код с .iloc, я получаю предупреждение.

Может ли кто-нибудь помочь мне понять это?

from sklearn.model_selection import StratifiedShuffleSplit

split = StratifiedShuffleSplit(n_splits=1, test_size=0.2, random_state=42)

for train_index, test_index in split.split(housing, housing["income_cat"]):
    strat_train_set = housing.loc[train_index]
    strat_test_set = housing.loc[test_index]

for set_ in (strat_train_set, strat_test_set):
    set_.drop("income_cat", axis=1, inplace=True)

Пробовали ли вы сбросить индекс после использования iloc? Если вы анализируете подмножество, особенно если вы создаете/обновляете/вычисляете новые значения в том же фрейме данных, который был вырезан в подмножество оригинала, это предупреждение, как правило, появляется.

Joe 27.08.2019 15:26
Почему в Python есть оператор "pass"?
Почему в Python есть оператор "pass"?
Оператор pass в Python - это простая концепция, которую могут быстро освоить даже новички без опыта программирования.
Некоторые методы, о которых вы не знали, что они существуют в Python
Некоторые методы, о которых вы не знали, что они существуют в Python
Python - самый известный и самый простой в изучении язык в наши дни. Имея широкий спектр применения в области машинного обучения, Data Science,...
Основы Python Часть I
Основы Python Часть I
Вы когда-нибудь задумывались, почему в программах на Python вы видите приведенный ниже код?
LeetCode - 1579. Удаление максимального числа ребер для сохранения полной проходимости графа
LeetCode - 1579. Удаление максимального числа ребер для сохранения полной проходимости графа
Алиса и Боб имеют неориентированный граф из n узлов и трех типов ребер:
Оптимизация кода с помощью тернарного оператора Python
Оптимизация кода с помощью тернарного оператора Python
И последнее, что мы хотели бы показать вам, прежде чем двигаться дальше, это
Советы по эффективной веб-разработке с помощью Python
Советы по эффективной веб-разработке с помощью Python
Как веб-разработчик, Python может стать мощным инструментом для создания эффективных и масштабируемых веб-приложений.
2
1
563
2
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 2

Ответ принят как подходящий

Проблема здесь не из-за индексации, iloc и loc будут работать для вас одинаково. Проблема в set_.drop("income_cat", axis=1, inplace=True). Похоже, что между фреймом данных set_ и strat_train_set и strat_test_set есть слабая ссылка.

for set_ in (strat_train_set, strat_test_set):
         print(set_._is_copy)

При этом вы получаете:

<weakref at 0x128b30598; to 'DataFrame' at 0x128b355c0>
<weakref at 0x128b30598; to 'DataFrame' at 0x128b355c0>

Это может привести к SettingWithCopyWarning, поскольку он пытается преобразовать копию фрейма данных и применить эти изменения к исходным.

Я провел некоторое исследование, и, насколько я понимаю, это то, что находится под капотом SettingWithCopyWarning: каждый раз, когда фрейм данных df создается из другого фрейма df_orig, pandas использует некоторые эвристики, чтобы определить, скопированы ли данные может быть неявно из df_orig, что менее опытный пользователь может не знать. Если да, то в поле _is_copydf устанавливается значение слабая ссылкаdf_orig. Позже, когда будет предпринята попытка обновить df на месте, pandas определит, следует ли отображать SettingWithCopyWarning, на основе df._is_copy, а также некоторых других полей df (обратите внимание, что df._is_copy здесь не единственный критерий). Однако, поскольку некоторые методы являются общими для разных сценариев, эвристика не идеальна, и в некоторых случаях можно ошибиться.

В коде из поста и housing.loc[train_index], и housing.iloc[train_index] возвращают неявную копию фрейма данных housing.

for df in (housing.loc[train_index], housing.iloc[train_index]):
    print(df._is_view, df._is_copy)

Приведенная выше проверка дает следующий результат:

False None
False <weakref at 0x0000019BFDF37958; to 'DataFrame' at 0x0000019BFDF26550>

Здесь _is_view — это еще одно поле, которое показывает, может ли обновление df повлиять на исходный фрейм данных housing. Результат False указывает на то, что базовые данные уже копируются. Однако для housing.loc[train_index] поле df._is_copy не установлено, что, на мой взгляд, должно быть в этом случае, что приводит к отсутствию SettingWithCopyWarning впоследствии, когда модификация df на месте выполняется оператором df.drop("income_cat", axis=1, inplace=True).

Чтобы избежать SettingWithCopyWarning, вам необходимо либо (1) выполнить обновление на месте перед нарезкой; (2) по возможности встроить логику обновления в нарезку; или (3) сделать «явную» копию данных после нарезки, когда требуется обновление на месте. В вашем примере подход (1) выглядит так:

# Updates the housing data frame in-place before slicing
income_cat = housing["income_cat"]
housing.drop("income_cat", axis=1, inplace=True)

for train_index, test_index in split.split(housing, income_cat):
    strat_train_set = housing.loc[train_index]
    strat_test_set = housing.loc[test_index]

Подход (2) выглядит так:

feature_cols = housing.columns.difference(["income_cat"])
for train_index, test_index in split.split(housing, housing["income_cat"]):
    # Filter columns at the same time as slicing the rows
    strat_train_set = housing.loc[train_index, feature_cols]
    strat_test_set = housing.loc[test_index, feature_cols]

Подход (3) выглядит так:

for train_index, test_index in split.split(housing, housing["income_cat"]):
    ...

for set_ in (strat_train_set, strat_test_set):
    # Remove "inplace=True" results in a copy being made
    set_.drop("income_cat", axis=1)

Помимо изменения параметра inplace метода обновления, df.copy() — это еще один метод, который можно использовать для создания «явной» копии. Если вы собираетесь изменить один или несколько столбцов df, используйте df.assign(col=...) для создания копии, а не df["col"]=....

Другие вопросы по теме