Сопоставление нескольких букв в строках

Я хочу определенным образом проанализировать свой набор данных, но, к сожалению, несмотря на то, что потратил много времени на R, я так и не смог понять, как выполнить поставленную задачу. Ниже то, что я хочу сделать:

Имя набора данных: Proteome (в этом наборе данных тысячи строк и 14 столбцов: ниже я показываю только четыре записи в столбце 5)

Row 1, column 5: GHFCLKPGCNFHAESTRGYR
Row 2, column 5: FCLKPGCNFHAESTRGYR
Row 3, column 5: GHFCLKPGCNFHAESTR
Row 4: column 5: GCNFHAESTR

Во 2-й строке пропущены первые две буквы 1-й строки; в строке 3 пропущены последние три буквы строки 1; в строке 4 пропущены первые семь и последние три буквы строки 1.

Строки 2, 3 и 4 отражают артефакты научного метода, который я использовал для получения данных, и поэтому я хочу удалить эти записи.

В идеале я хочу, чтобы R возвращал мне верхнюю запись, но было бы нормально, если бы R мог сворачивать такие строки только в одну строку. Моя идея состоит в том, чтобы свернуть несколько строк в одну, если пять последовательных букв в этих строках совпадают друг с другом. В приведенном выше примере GCNFHAESTR совпадает во всех четырех строках, поэтому я хочу, чтобы R вернул мне только одну строку, в идеале верхнюю.

действительно, будет полезно, если вы предоставите несколько примеров строк, которые не совпадают со строкой 4. Сколько строк в вашем наборе данных?

demarsylvain 26.03.2019 21:18

Выполняли ли вы какие-либо поиски в Google в поисках методов выравнивания с использованием пакета от BioConductor?

IRTFM 26.03.2019 21:43

@db код вернул следующее: структура(c(4L, 1L, 3L, 2L, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA), .Label = c("FCLKPGCNFHAESTRGYR", "GCNFHAESTR", "GHFCLKPGCNFHAESTR", "GHFCLKPGCNFHAESTRGYR"), class = "factor")

msaeed 27.03.2019 00:02

@demarsylvain В моем наборе данных около 6000 строк. Впервые задаю вопрос на этом форуме. Может ли кто-нибудь помочь мне, как я могу показать изображение моего фрейма данных. Я пытался вставить скриншот, но это тоже не сработало. Спасибо!

msaeed 27.03.2019 00:52

Пожалуйста, проверьте часть моего фрейма данных здесь (если это не работает, скопируйте и вставьте URL-адрес на новую страницу): i67.tinypic.com/2wd0ap3.png[/IMG]

msaeed 27.03.2019 00:59
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2026-2027 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
0
5
53
0

Другие вопросы по теме