Сортировка агрегированного DataFrame в Python

Ваш агрегированный фрейм данных имеет многоуровневый индекс столбца. Поэтому вам нужно решить эту проблему, указав как senority_level, так и mean.

df_agg.sort_values(('seniority_level', 'mean'), ascending=False)

Быстрая проверка для демонстрации:

df = pd.DataFrame({
    'Accounting': [1, 2, 3],
    'Acoustics': [4, 5, 6],
}).melt(var_name='Subject Field', value_name='seniority_level')
df_agg = df.groupby('Subject Field').agg(
    {'seniority_level':['min', 'mean', 'median']}
)

df_agg.sort_values(('seniority_level','mean'), ascending=True)

              seniority_level            
                          min mean median
Subject Field                            
Accounting                  1    2      2
Acoustics                   4    5      5

df_agg.sort_values(('seniority_level','mean'), ascending=False)

              seniority_level            
                          min mean median
Subject Field                            
Acoustics                   4    5      5
Accounting                  1    2      2