Совокупный процент в нескольких группах

Предположим, есть больничная клиника, в которой есть список пациентов, посещающих больницу каждый день. У меня есть данные за 10 лет – но пациенты не посещают клинику каждый день. Для примера: данные выглядят так (в R):

library(dplyr)

set.seed(123)

start_date <- as.Date("2010-01-01")
end_date <- as.Date("2019-12-31")
all_dates <- seq.Date(start_date, end_date, by = "day")

num_visits <- sample(1:length(all_dates), size = 3000, replace = FALSE)
visit_dates <- all_dates[num_visits]

num_patients <- sample(1:100, size = length(visit_dates), replace = TRUE)

clinic_data <- data.frame(date = visit_dates, num_patients = num_patients)

hospital_data <- clinic_data %>% arrange(date)

       date num_patients
 2010-01-01           90
 2010-01-02           96
 2010-01-04           65
 2010-01-05           80
 2010-01-06           15
 2010-01-07           87

Я хочу попытаться ответить на следующий вопрос: В среднем за любой месяц какой процент всех пациентов в этом месяце посетят клинику к дню $y$? Например, предположим, что в каком-то месяце я знаю, что 900 человек посетили больницу - я хочу знать, что к 19-му числу, какой процент (в совокупности) из этих 900, вероятно, посетил больницу К ТОМ, исходя из предыдущих тенденций?

Я попытался сделать это, вручную определив различные логические шаги:

library(ggplot2)

hospital_data$year <- as.numeric(format(as.Date(hospital_data$date), "%Y"))
hospital_data$month <- as.numeric(format(as.Date(hospital_data$date), "%m"))
hospital_data$day <- as.numeric(format(as.Date(hospital_data$date), "%d"))

hospital_data <- hospital_data[order(hospital_data$date), ]

yearly_totals <- aggregate(num_patients ~ year, data = hospital_data, FUN = sum)
names(yearly_totals)[2] <- "yearly_total"

hospital_data <- merge(hospital_data, yearly_totals, by = "year")

results <- by(hospital_data, hospital_data$year, function(df) {
    df$cumulative_patients <- cumsum(df$num_patients)
    df$cumulative_percentage <- df$cumulative_patients / df$yearly_total * 100
    return(df)
})
results <- do.call(rbind, results)

avg_results <- aggregate(cumulative_percentage ~ day, data = results, FUN = mean, na.rm = TRUE)

avg_results <- avg_results[order(avg_results$day), ]

ggplot(avg_results, aes(x = day, y = cumulative_percentage)) +
    geom_line() +
    geom_point() +
    scale_x_continuous(breaks = seq(1, 31, by = 5)) +
    scale_y_continuous(limits = c(0, 100)) +
    labs(title = "Average Cumulative Percentage of Yearly Patients by Day",
         x = "Day of Month",
         y = "Average Cumulative Percentage of Patients") +
    theme_minimal() +
    theme(panel.grid.minor = element_blank())

Но мой график не отображает этот совокупный процент:

Есть ли у кого-нибудь идеи, где я это испортил?

Обновлено:

library(tidyverse)

result <- hospital_data %>%
  mutate(month = floor_date(date, "month"),
         day = day(date)) %>%
  group_by(month) %>%
  arrange(month, day) %>%
  mutate(month_total = sum(num_patients),
         cuml = cumsum(num_patients),
         cuml_pct = cuml / month_total) %>%
  ungroup() %>%
  group_by(day) %>%
  summarize(avg_cuml_pct = mean(cuml_pct, na.rm = TRUE)) %>%
  arrange(day)

result <- result %>%
  mutate(avg_cuml_pct = cummax(avg_cuml_pct))

ggplot(result, aes(day, avg_cuml_pct)) +
  geom_line() +
  scale_y_continuous(labels = scales::percent_format(), limits = c(0, 1)) +
  scale_x_continuous(breaks = seq(0, 31, by = 5)) +
  labs(x = "Day of Month", 
       y = "Average Cumulative Percentage of Monthly Patients",
       title = "Average Cumulative Patient Percentage by Day of Month") +
  theme_minimal()

Я думаю, ваша цель не ясна. Вы говорите, что хотите получить совокупные проценты по месяцам, но затем рассчитываете итоговые суммы за год. Возможно, вы могли бы указать ожидаемый результат за первый месяц. И, пожалуйста, прочтите минимальный воспроизводимый пример, обратив внимание на слово минимальный.

Edward 13.08.2024 01:51
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
0
1
50
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Возможно, что-то вроде этого? Каждая из светло-серых линий представляет собой совокупный процент пациентов за каждый месяц по дням. Темная линия представляет собой невзвешенное среднее этих средних значений. Возможно, вам понадобится средневзвешенное значение, но здесь нет большой разницы, учитывая, что многие месяцы имеют аналогичный масштаб.

library(tidyverse)
hospital_data |>
  mutate(month = floor_date(date, "month"),
         day = day(date)) |>
  mutate(cuml = cumsum(num_patients),
         cuml_pct = cuml / sum(num_patients), .by = month) |>
  ggplot(aes(day, cuml_pct)) +
  geom_line(aes(group = month), alpha = 0.1) +
  geom_line(data = ~summarize(., cuml_pct = mean(cuml_pct), .by = day))

Или мы могли бы сделать то же самое на взвешенной основе, но учтите, что, поскольку в некоторых месяцах 31 день, это означает, что нам нужно до 31-го числа любого месяца (даже тех, в которых 28/29/30 дней), чтобы достичь 100%.

hospital_data |>
  mutate(day = day(date)) |>
  count(day, wt = num_patients) |> # = summarize(n = sum(num_patients), .by = day)
  arrange(day) |>
  mutate(cuml_pct = cumsum(n)/sum(n)) |>
  ggplot(aes(day, cuml_pct)) +
  geom_line()

спасибо, Джон Спринг! Это действительно круто! Дело в том, что окончательный график должен иметь только одну линию, которая представляет собой (совокупное общее количество населения в день x) / (население сегодня за все дни). Возможно ли это?

farrow90 13.08.2024 02:48

Конечно, просто закомментируйте предпоследнюю строку, чтобы получить невзвешенную версию. Я могу отредактировать, чтобы добавить взвешенную версию. Обратите внимание, что, например, при различной продолжительности месяцев тест предполагает, что для достижения 100% требуется 31-е число, даже если во многих месяцах не так много дней.

Jon Spring 13.08.2024 03:49

Другие вопросы по теме