Сценарий Bash, содержащий команды git, ведет себя по-разному при использовании вместе с perl

Я написал скрипт, который заменяет последние 3 цифры номера версии в файле, содержащем строку в этом формате.

"version-all:255.24.788"

Есть 2 режима работы скрипта: обычный и расширенный. Обычный режим просто вносит необходимые изменения, добавляет файлы в git и фиксирует их. Расширенная версия создает ветку для внесения этих изменений, изменяет файлы, добавляет, фиксирует, а затем возвращается к исходной рабочей ветке.

Я наблюдаю странное поведение при запуске скрипта. Скрипт работает при первом запуске, но при втором запуске он прекращает фиксацию результатов и пытается изменить ветку, что приводит к конфликтам слияния. Я не могу понять, почему скрипт сработает только нечетное количество раз (первый, третий, пятый раз), а когда запустится четное количество раз (второй, четвертый, шестой), произойдет сбой.

Я попытался изменить синтаксис переменных и заменить вызовы perl простым

echo "test" > file1.txt

для целей отладки, и тогда он, кажется, работает нормально. При обратном добавлении команд perl сценарий, кажется, возвращается к своему странному поведению.

#!/bin/bash
# This script replaces last 3 digits of a version number in a file
# There are 2 modes for the script
#   1. Regular - no flag needed, requires 1 argument: a version number
#   2. Advanced - flag "-a" needs to be used followed by 3 arguments: version number, push repo name, remote repo name.

advanced_script=false
version = "none"

if [ "$1" = "-a" ] ; then
    advanced_script=true
fi

if [ "$advanced_script" = true ] ; then 
    if [ $# -ne 4 ] ; then
        echo -e "ERROR: Please supply the following 3 arguments and try again.\n" 
        echo -e "       1. New version number\n"
        echo -e "       2. Push repository name\n"
        echo -e "       3. Remote repository name\n"
        exit 1
    fi
    version = "$2"
else
    if [ $# -ne 1 ] ; then
        echo -e "ERROR: Please supply version number and try again.\n"  
        exit 1
    fi 
    version = "$1"
fi

old_version_full = "version-all:255.24.788"
old_version=${old_version_full##*all:}
new_version=${old_version%.*}
new_version+ = ".${version}"

current_branch=$(git branch | grep \* | cut -d ' ' -f2)
commit_string = "Bump the version to $version"

if [ "$advanced_script" = true ] ; then 
    local_branch = "new_$version"
    remote_master = "$4/master"
    git stash
    git checkout -b "$local_branch" "$remote_master"
fi 

perl -i -pe"s/${old_version}/${new_version}/g" file1.txt
perl -i -pe"s/${old_version}/${new_version}/g" file2.txt

git add file1.txt
git add file2.txt

git status

git commit -m "$commit_string"

if [ "$advanced_script" = true ] ; then 
    git push "$3"
    git checkout "$current_branch"
    git stash apply
fi