Удаление карт с белой рамкой с помощью geom_sf

Я пытаюсь удалить белые границы вокруг фасетного участка, который я создал с помощью geom_sf(). Раньше я использовал устаревший пакет rgdal и coord_cartesian(). Я пытаюсь построить аналогичный график, используя geom_sf() и coord_sf(), но, похоже, не могу заставить его работать.

Мой код:

land <- sf::read_sf("./shapefiles/Grey_WA_OR.shp")
land <- sf::st_transform(land, crs = "+proj=longlat +datum=WGS84")

water <- sf::read_sf("./shapefiles/NW_Marine.shp")
water <- sf::st_transform(water, crs = "+proj=longlat +datum=WGS84")

heatmap <- ggplot()+ theme_bw()+
  geom_sf(data = water, fill = "paleturquoise3", color = "turquoise4") +
  geom_sf(data = land, fill='grey96') +
  coord_sf(xlim = c(-126.3, -122.3), ylim = c(48.3, 50.39)) +
  geom_point(data= CPUE.bymonth.mean.nonzero, mapping = aes(x=Lon, y=Lat, 
            size=MeanCPUE), alpha = 0.5, colour= "coral", stroke = 0.7)+  
  geom_point(data = CPUE.bymonth.mean.zeros, mapping = aes(x = Lon, y = Lat, 
                          size = MeanCPUE), alpha = 0.7, color = "gray25") +
  scale_size_continuous(breaks = c(0, 500,1000, 3000), name = "Mean CPUE", 
                        range = c(2.5,15)) +
  theme(axis.text.x = element_blank(),
        axis.text.y = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.title.x = element_blank(), 
        axis.title.y = element_blank(),
        panel.grid.major = element_blank(),
        panel.grid.minor = element_blank())+
  guides(size = guide_legend(override.aes = list(color = 
        c("gray25","coral","coral", "coral"), alpha = 0.6), size = 12))+
  facet_grid(Year ~ Month)+
  theme(
    strip.text.x = element_text(size = 12, color = "black", face = "bold"),
    strip.text.y = element_text(size = 12, color = "black", face = "bold"))

ggsave(filename = "figures/CPUE_map.png", plot = heatmap, 
       width = 12, height = 6, dpi = 600 )

Что я получаю:

Удаление карт с белой рамкой с помощью geom_sf

Что я надеюсь получить:

Удаление карт с белой рамкой с помощью geom_sf

Я просмотрел пакет Cowplot, но, к сожалению, не смог заставить его работать, не уверен, содержит ли этот пакет решение? Я также пробовал удалить поля с помощью theme(plot.margin = unit(c(0,0,0,0), "cm")), но безуспешно.

Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
0
0
68
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Проблема заключается в том, что вы сохраняете ту же ширину и высоту вашего первого ggsave() вывода, даже если вы спроецировали свои данные в WGS84/EPSG:4326. Обратите внимание, что остров Ванкувер на первом изображении гораздо более вытянут по сравнению со вторым. Это потому, что coord_sf() автоматически отображает данные в относительных координатах научно-фантастического объекта. При использовании coord_cartesian() значения x и y считаются равными. Если вам нужно заполнить область графика, у вас есть три варианта:

  1. Сохраните те же значения xlim/ylim в coord_sf() и просто отрегулируйте значения ширины и высоты в ggave().
  2. Редактируйте значения xlim/ylim в coord_sf(), пока выходные данные не будут соответствовать существующим значениям ширины и высоты.
  3. Преобразуйте ваши объекты научной фантастики в фреймы данных и отобразите их, используя geom_polygon() в сочетании с coord_fixed().

Этот упрощенный репрекс демонстрирует варианты 1 и 3, последний, я считаю, вам нужен. Поскольку вы не предоставили никаких образцов данных, я использовал набор данных ne_countries() из пакета rnaturalearth вместо слова «земля». Для простоты я создал только точки выборки, представляющие «CPUE.bymonth.mean.nonzero», и использовал panel.background = вместо «воды».

Опция 1

library(rnaturalearth)
library(sf)
library(dplyr)
library(ggplot2)

# Load world map data
land <- ne_countries(scale = "medium")

# Create sample point data
set.seed(1)
CPUE.bymonth.mean.nonzero <- data.frame(Lon = runif (10, -126, -124),
                                        Lat = runif (10, 48.5, 49.5),
                                        Year = rep(c(2022, 2023), each = 5),
                                        Month = rep(month.abb[4:8], 2),
                                        MeanCPUE = sample(100:4000, 10))

# Plot
heatmap <- ggplot() +
  geom_sf(data = land) +
  geom_point(data= CPUE.bymonth.mean.nonzero,
             aes(x = Lon, y = Lat, size = MeanCPUE),
             alpha = 0.5, 
             colour = "coral",
             stroke = 0.7) +
  coord_sf(xlim = c(-126.2986, -122.2988), 
           ylim = c(48.30015, 50.39008)) +
  scale_size_continuous(breaks = c(0, 500,1000, 3000), 
                        name = "Mean CPUE", 
                        range = c(2.5, 15)) +
  theme_bw() +
  theme(axis.text.x = element_blank(),
        axis.text.y = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.title.x = element_blank(), 
        axis.title.y = element_blank(),
        panel.background = element_rect(fill = "paleturquoise3", colour = NA),
        legend.key = element_rect(fill = "white", colour = NA),
        panel.grid.major = element_blank(),
        panel.grid.minor = element_blank()) +
  guides(size = guide_legend(override.aes = list(color = c("coral", "coral", "coral"), 
                                                 alpha = 0.6), size = 12)) +
  facet_grid(Year ~ Month) +
  theme(strip.text.x = element_text(size = 12, color = "black", face = "bold"),
        strip.text.y = element_text(size = 12, color = "black", face = "bold"))

ggsave("figures/CPUE_map.png",
       heatmap, 
       width = 12,
       height = 3.8,
       dpi = 600)

Вот результат, обратите внимание, что разрешение этого изображения составляет всего 150 точек на дюйм:

Вариант 3

В этом примере я использовал coord_fixed(ratio = 2.5), что, похоже, очень похоже на ваш исходный сюжет. При необходимости отрегулируйте.

# Convert land sf to df
land_df <- land |>
  select(geometry) |>
  st_cast("POLYGON") |>
  st_coordinates() |>
  as.data.frame() |>
  rename(lon = X, lat = Y)

# Plot
heatmap <- ggplot() +
  geom_polygon(data = land_df, 
               aes(x = lon, y = lat, group = L2),
               fill = "grey96",
               colour = "turquoise4") +
  geom_point(data= CPUE.bymonth.mean.nonzero,
             aes(x = Lon, y = Lat, size = MeanCPUE),
             alpha = 0.5, 
             colour = "coral",
             stroke = 0.7) +
  coord_fixed(xlim = c(-126.2986, -122.2988), 
              ylim = c(48.30015, 50.39008),
              ratio = 2.5) +
  scale_size_continuous(breaks = c(0, 500,1000, 3000), 
                        name = "Mean CPUE", 
                        range = c(2.5, 15)) +
  theme_bw() +
  theme(axis.text.x = element_blank(),
        axis.text.y = element_blank(),
        axis.ticks = element_blank(),
        axis.title.x = element_blank(), 
        axis.title.y = element_blank(),
        panel.background = element_rect(fill = "paleturquoise3", colour = NA),
        legend.key = element_rect(fill = "white", colour = NA),
        panel.grid.major = element_blank(),
        panel.grid.minor = element_blank()) +
  guides(size = guide_legend(override.aes = list(color = c("coral", "coral", "coral"), 
                                                 alpha = 0.6), size = 12)) +
  facet_grid(Year ~ Month) +
  theme(strip.text.x = element_text(size = 12, color = "black", face = "bold"),
        strip.text.y = element_text(size = 12, color = "black", face = "bold"))

ggsave("figures/CPUE_map.png",
       heatmap, 
       width = 12,
       height = 6,
       dpi = 600)

Опять же, этот пример построен с разрешением 150 точек на дюйм, но значения ширины и высоты в ggsave() соответствуют исходному графику.

Спасибо за ваш комментарий - очень полезно, и мои извинения за то, что не предоставил повторения. Регулируя xlim/ylim, я действительно могу уменьшить/удалить белую рамку вокруг графика фасетной сетки, хотя, наверное, я надеялся, что смогу сохранить тот же xlim/ylim и «удлинить» графики (сохраняя при этом те же параметры). CRS), возможно, изменить соотношение сторон? Будет ли это желательно при построении карт? редактировать: я понимаю, что могу изменить соотношение сохраненного файла .png, но это также влияет на легенду. Просто пытаюсь понять, есть ли обходной путь.

Tim Van Der Stap 27.06.2024 20:53

Я напутал с редактированием своего комментария, прошу прощения. Когда я изначально создавал графики с помощью rgdal/coord_cartesian, я использовал WGS84, поэтому, думаю, я бы предпочел продолжать использовать этот CRS. Я посмотрю geom_polygon(), спасибо за предложение!

Tim Van Der Stap 27.06.2024 20:59

@L Тайрон, это потрясающе и именно то, что я искал, большое спасибо!

Tim Van Der Stap 28.06.2024 17:43

Другие вопросы по теме