Я создал файл кровати, подобный этому
Simple_repeat KQ420259.1 45090 45150 (TTAT)n . +
Simple_repeat KQ420259.1 46815 46864 (TG)n . +
Simple_repeat KQ420259.1 47062 47104 (GT)n . +
SINE/tRNA-Deu KQ420259.1 49227 49290 AmnSINE2 . +
Simple_repeat KQ416943.1 112522 112609 (ATAC)n . +
Simple_repeat KQ416943.1 113250 113283 (ACA)n . +
Simple_repeat KQ416943.1 113283 113358 (ACT)n . +
Simple_repeat KQ416943.1 117308 117357 (AC)n . +
Simple_repeat KQ416943.1 117357 117435 (ACAC)n . +
Simple_repeat KQ416944.1 117964 118025 (TATG)n . +
DNA/TcMar KQ416944.1 121083 121651 HSMAR1 . +
Low_complexity KQ416944.1 124929 124970 A-rich . +
и я бы удалил все строки, содержащие KQ416943.1
. Я не знаю, существует ли способ сделать это, сохранив порядок. Я буду признателен за вашу помощь. Спасибо
почему бы нет? есть имена, должности, пряди. Я думаю, что это
3 первых столбца файла BED: CHROM/START/END: genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html#format1
Возможный дубликат Удалить строки в текстовом файле, содержащие определенную строку
попробуй это:
grep -v "KQ416943.1" yourfile.txt > output.txt
1) это не файл BED. 2) поиск
grep