Проблема возникает, когда я открываю файлы из окна удаленного хоста.
К сожалению, сейчас это нельзя отключить.
Это известная проблема, и она уже исправлена (WI-55870: закрепление по умолчанию удалено) для следующей минорной версии 2020.3.1.
Сборка EAP 2020.3.1 должна быть доступна позже на этой неделе, чтобы вы могли ее попробовать (следите за обновлениями в блоге PhpStorm), а фактический выпуск ожидается в конце этого месяца.
Большое спасибо! Прямо сейчас, когда вы указываете на это. Проблема появилась только после обновления: -/
Поделитесь, пожалуйста, некоторыми подробностями: какие файлы/как вы с ними работаете. Если вы можете сделать несколько скриншотов (а лучше небольшое видео или гифку), которые наглядно показывали бы процесс, это дало бы некоторые подсказки о том, что происходит/на что обращать внимание.