Я получаю более одного вывода в python 3.x

Поскольку вы печатаете его в цикле, просто внесите следующее изменение:

lista=[]
lista = [int(clan) for clan in input("Unesi članove niza : ").split(',')]
lista.reverse()
rezultat=[]
for i in lista:
    if i < 0:
        i = i * -1
        t = i
        rev = 0
        rev = rev * 10 + t % 10
        t = t // 10
        i = i * -1
        rezultat.append(str(i))
    else:
            t = i
            rev = 0
    while t > 0:
        rev = rev * 10 + t % 10
        t = t // 10
        if rev == i:
            rezultat.append(str(i))
print(','.join(rezultat))

Вот вам однострочка :)

sample = [121, 23, 2, 3883]
print(sorted(filter(lambda x: str(x) == str(x)[::-1], sample),reverse=True))

попробуй удалить print(','.join(rezultat)) из блока while

Я думаю, что это должно остановить повторяющиеся результаты