Есть ли событие или что-то, что я могу использовать, когда showdialogwindow блокирует окно, к которому я пытаюсь получить доступ?

Когда вы щелкаете за пределами модального окна, управляемое событие не возникает, но вы должны иметь возможность обрабатывать это в модальном окне, используя некоторый p/invoke. Вот вам пример:

public sealed partial class ModalWindow : Window, IDisposable
{
    [DllImport("User32.dll")]
    public static extern IntPtr SetWindowsHookEx(int idHook, HookDelegate lpfn, IntPtr hmod, int dwThreadId);

    [DllImport("User32.dll")]
    public static extern IntPtr CallNextHookEx(IntPtr hHook, int nCode, IntPtr wParam, IntPtr lParam);

    [DllImport("User32.dll")]
    public static extern IntPtr UnhookWindowsHookEx(IntPtr hHook);

    [DllImport("user32.dll")]
    public static extern bool GetCursorPos(out POINT lpPoint);

    [StructLayout(LayoutKind.Sequential)]
    public struct POINT
    {
        public int X;
        public int Y;

        public static implicit operator Point(POINT point)
        {
            return new Point(point.X, point.Y);
        }
    }

    public delegate IntPtr HookDelegate(int code, IntPtr wParam, IntPtr lParam);

    private const int WH_MOUSE_LL = 14;
    private const int WM_LBUTTONDOWN = 0x0201;
    private HookDelegate mouseDelegate;
    private IntPtr mouseHandle;

    public ModalWindow()
    {
        InitializeComponent();
        mouseDelegate = MouseHookDelegate;
        mouseHandle = SetWindowsHookEx(WH_MOUSE_LL, mouseDelegate, IntPtr.Zero, 0);
    }

    private IntPtr MouseHookDelegate(int code, IntPtr wParam, IntPtr lParam)
    {
        if (code < 0)
            return CallNextHookEx(mouseHandle, code, wParam, lParam);

        switch ((int)wParam)
        {
            case WM_LBUTTONDOWN:
                POINT lpPoint;
                GetCursorPos(out lpPoint);
                if (lpPoint.X < Left || lpPoint.X > (Left + Width) || lpPoint.Y < Top || lpPoint.Y > (Top + Height))
                {
                    //Outside click detected...
                }
                break;
        }

        return CallNextHookEx(mouseHandle, code, wParam, lParam);
    }

    protected override void OnClosed(EventArgs e)
    {
        Dispose();
        base.OnClosed(e);
    }

    public void Dispose()
    {
        if (mouseHandle != IntPtr.Zero)
            UnhookWindowsHookEx(mouseHandle);
    }
}

Если вы хотите восстановить второе окно, когда оно свернуто и пользователь нажимает на первое (заблокированное) окно, вы можете пойти по этому пути (добавьте этот код в WindowB):

public WindowB()
{
    PreviewMouseDown += WindowB_PreviewMouseDown;
    StateChanged += WindowB_StateChanged;
    InitializeComponent();
    LostMouseCapture += WindowB_LostMouseCapture;

}

private void WindowB_LostMouseCapture(object sender, MouseEventArgs e)
{
    //You can also evaluate here a mouse coordinates.
    if (WindowState == WindowState.Minimized)
    {
        e.Handled = true;
        CaptureMouse();
    }
}

private void WindowB_StateChanged(object sender, EventArgs e)
{
    if (WindowState== WindowState.Minimized)
    {
        CaptureMouse();
    }
    else
    {
        ReleaseMouseCapture();
    }
}

private void WindowB_PreviewMouseDown(object sender, MouseButtonEventArgs e)
{
    WindowState = WindowState.Normal;
    Debug.WriteLine("WindowB PreviewMouseDown");
}

Таким образом, вы должны начать захват мыши во втором окне, когда оно свернуто, потому что, если пользователь нажмет на WindowA, это можно будет обработать на WindowB.
Когда окно свернуто, захват мыши будет потерян (поэтому вы должны слушать LostMouseCapture), что вы должны предотвратить.

Левая кнопка мыши на WindowA восстанавливает тогдаWindowB.