Змеетворение + сингулярность, избавление от зависимости от python

У меня немного странный вопрос: рассмотрим случай контейнерного рабочего процесса, когда весь рабочий процесс выполняется с использованием одного единственного контейнера. Это по-прежнему требует, чтобы python был доступен в системе для вызова змейки --use-singularity, верно? Как я могу избавиться от этой зависимости? Могу ли я просто установить Python, Snakemake и Singularity в свой контейнер и выполнить

singularity exec my-container snakemake --use-singularity

Это безопасно для использования с кластерными конфигурациями?

Редактировать: похоже, вообще не работает - я не смог заставить змейку с сингулярностью работать из другого контейнера...

удар. очевидно, это имеет смысл только в кластерной среде, поскольку в противном случае я мог бы просто вызвать змейку без --singularity в ее собственном контейнере...
Jack 20.03.2019 19:25
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
1
1
105
0

Другие вопросы по теме