Базовое приложение с модулями es6 не работает в хроме — ERR_ABORTED 404 (не найдено)

Вы должны включить статические файлы, обслуживающие, добавив следующую строку в свой файл server.js:

app.use('/', express.static(__dirname + '/'));

поэтому ваш файл должен выглядеть так:

const express = require('express')
const app = express()
const port = 3000

app.use('/', express.static(__dirname + '/'));

app.get('/', function(req, res) {
    res.sendFile('index.html',{ root: __dirname });
});

app.listen(port);