Чтение двоичного файла с помощью Julia

Привет, я новичок в Джулии и пытаюсь с ней кое-что обработать. У меня много файлов в двоичном формате. Я использую F90 для обработки. Файл, который я пишу, выглядит так

open(11,file = "ring.grid",form = "unformatted")

write(11)nv
write(11)Nx,Ny,Nzt
write(11) xx
write(11) yy
write(11) zz
close(11)


где nv,nx,ny,nzt — целые числа, а xx,yy,zz — трехмерная матрица. В F90 я использую этот простой блок для чтения файла

open(11,file='ring.grid',form='unformatted')
read(11)nd
read(11)n1,n2,n3
read(11)xx
read(11)yy
read(11)zz
close(11)

Но мне трудно читать это с Юлей. Кто-нибудь может мне помочь с этим? Спасибо

Я попробовал использовать

io=read(NAMEFILE)
y=Array{UInt8,1}(undef,1)
read!(io,y)

Но я не знаю, как разделить nv,n1,n2,n3,xx,yy,zz в разных массивах.

Двоичные файлы доступа к Фортрану sequential имеют специальный формат, который может не распознаваться другими языками. Открытие файла и запись с доступом stream может помочь устранить ошибку. Найдите «поток программирования на Фортране IO».

Scientist 13.04.2024 21:37

Возможно, проще всего вызвать какой-нибудь Фортран из Джулии, если вам нужно прочитать стандартные неформатированные файлы Фортрана.

Ian Bush 13.04.2024 21:53

Или вы можете посмотреть FortranFiles.jl traktofon.github.io/FortranFiles.jl/stable

Ian Bush 13.04.2024 21:57

Или, в более общем смысле, если вы хотите выполнить обмен данными, используйте формат файла обмена данными.

francescalus 14.04.2024 13:59
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Стоит ли изучать PHP в 2023-2024 годах?
Привет всем, сегодня я хочу высказать свои соображения по поводу вопроса, который я уже много раз получал в своем сообществе: "Стоит ли изучать PHP в...
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
Поведение ключевого слова "this" в стрелочной функции в сравнении с нормальной функцией
В JavaScript одним из самых запутанных понятий является поведение ключевого слова "this" в стрелочной и обычной функциях.
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Приемы CSS-макетирования - floats и Flexbox
Здравствуйте, друзья-студенты! Готовы совершенствовать свои навыки веб-дизайна? Сегодня в нашем путешествии мы рассмотрим приемы CSS-верстки - в...
Тестирование функциональных ngrx-эффектов в Angular 16 с помощью Jest
В системе управления состояниями ngrx, совместимой с Angular 16, появились функциональные эффекты. Это здорово и делает код определенно легче для...
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Концепция локализации и ее применение в приложениях React ⚡️
Локализация - это процесс адаптации приложения к различным языкам и культурным требованиям. Это позволяет пользователям получить опыт, соответствующий...
Пользовательский скаляр GraphQL
Пользовательский скаляр GraphQL
Листовые узлы системы типов GraphQL называются скалярами. Достигнув скалярного типа, невозможно спуститься дальше по иерархии типов. Скалярный тип...
1
4
178
1
Перейти к ответу Данный вопрос помечен как решенный

Ответы 1

Ответ принят как подходящий

Предположим, что полный код F90 для записи данных выглядит следующим образом:

program SaveGrid
    implicit none

    integer :: nv
    integer :: Nx, Ny, Nzt
    real, dimension(:), allocatable :: xx, yy, zz
    integer :: i

    nv = 3
    Nx = 5
    Ny = 7
    Nzt = 10

    allocate(xx(Nx), yy(Ny), zz(Nzt))

    do i = 1, Nx
        xx(i) = float(i)
    end do
    do i = 1, Ny
        yy(i) = float(i) * 2.0
    end do
    do i = 1, Nzt
        zz(i) = float(i) * 3.0
    end do

    open(unit=11, file = "ring.grid", form = "unformatted")

    write(11) nv
    write(11) Nx, Ny, Nzt
    write(11) xx
    write(11) yy
    write(11) zz

    close(11)

    deallocate(xx, yy, zz)
end program SaveGrid

Чтобы прочитать это в Julia, вам нужно обработать способ записи неформатированных данных F90.

function read_fortran_binary(filename)
    open(filename, "r") do file
        # Read record marker.
        record_size = read(file, Int32)
        # Read data.
        nv = read(file, Int32)
        # Read record marker.
        end_record_size = read(file, Int32)

        # Read record marker.
        read(file, Int32)
        # Read data.
        Nx = read(file, Int32)
        Ny = read(file, Int32)
        Nzt = read(file, Int32)
        # Read record marker.
        read(file, Int32)

        return nv, Nx, Ny, Nzt
    end
end

nv, Nx, Ny, Nzt = read_fortran_binary("ring.grid")

println("nv:  ", nv)
println("Nx:  ", Nx)
println("Ny:  ", Ny)
println("Nzt: ", Nzt)

Маркеры записей имеются как до, так и после каждого фрагмента данных, записанного в файл. Вам тоже нужно прочитать это. Очевидно, вам не нужно игнорировать эти данные, и размеры записей можно использовать, чтобы сделать ваш код Julia более надежным и гибким за счет изменений в неформатированных данных F90.

nv:  3
Nx:  5
Ny:  7
Nzt: 10

Вы делаете предположения о формате неформатированного файла Фортрана - нет никакой гарантии, что формат такой, как у вас выше, стандарт Фортрана ничего не говорит о том, как его следует реализовать. Разные компиляторы могут различаться, и известно, что разные версии одного и того же компилятора различаются. Вот почему я думаю, что вызов Фортрана для чтения, вероятно, лучший способ.

Ian Bush 14.04.2024 08:34

Я согласен с заявлением @IanBush. Двоичные файлы, которые предполагается читать на других языках, должны быть записаны с модификатором access = "stream", который подавляет маркеры записи.

PierU 14.04.2024 10:55

Также есть модификации для записей >2 Гб.

Vladimir F Героям слава 14.04.2024 12:33

WRT access = "stream" Я думаю, было бы полезно, если бы ОП разъяснил их вариант использования: нужно ли читать множество существующих файлов, которые невозможно легко восстановить, или файлы легко перезаписываются или восстанавливаются в другом формате?

Ian Bush 14.04.2024 13:31

Другие вопросы по теме