Вы упоминаете tomcat 9, но на вашем снимке экрана показан tomcat 6.0.29.
обновить до Tomcat 8 или 9
@sjahan, у меня установлены оба tomcat 9 и 7, я попытался переключить сервер, чтобы изолировать, если проблема с tomcat или с jdk, пока я предполагаю, что проблема с jdk 10




Показан следующий текст, в котором рассматриваются вопросы, поднятые вами относительно Экспорт исходных файлов и Перезаписать существующий файл:
Optionally, supply WAR export Options, such as whether or not to include Java™ source files in the WAR, and whether to overwrite any existing resources during the export process. Source files are not usually included in a WAR file, because they are not necessary for the server to run the web application.
Раньше у меня Tomcat 9 нормально работал с Java 10. Вам требуются правильные модули?