Как изменить все права доступа к файлам и папкам в одной папке с помощью node.js

Вы можете установить модуль chmodr.

var chmodr = require('chmodr');

chmodr('/folder', 0o777, (err) => {
  if (err) {
    console.info('Failed to execute chmod', err);
  } else {
    console.info('Success');
  }
});

В качестве альтернативы вы можете посмотреть его реализация, это небольшой файл из 100 строк, он рекурсивно вызывает fs.chmod / fs.chmodSync для всех дочерних элементов каталога.